panduan protein datagigiuh bank
TRANSCRIPT
-
8/18/2019 Panduan Protein Datagigiuh Bank
1/3
Panduan Menggunakan Protein Data Bank (PDB)
1. Buka situs Protein Data Bank:
http://pdb.org atau http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do
2. Tampilan halaman depan situs Protein Data Bank:
3. Ketik nama protein yang akan dicari pada kotak pencarian:
http://pdb.org/http://www.rcsb.org/pdb/home/home.dohttp://www.rcsb.org/pdb/home/home.dohttp://pdb.org/
-
8/18/2019 Panduan Protein Datagigiuh Bank
2/3
4. Berikut contoh hasil pencarian. Pilih salah satu protein yang memiliki ligan,kemudian klik pada kode PDB-nya:
5. Berikut adalah tampilan halaman protein yang telah dipilih:
-
8/18/2019 Panduan Protein Datagigiuh Bank
3/3
6. Di bagian bawah halaman terdapat kotak berjudul “Small Molecules”. Pastikanterdapat paling sedikit satu molekul ligan pada kotak tersebut:
7. Unduh struktur protein dengan klik tombol “Download Files” --> “PDB Format”