struktur protein -.ppt

Upload: irman-pahlepi

Post on 29-Oct-2015

179 views

Category:

Documents


4 download

DESCRIPTION

struktur protein -.ppt

TRANSCRIPT

  • STRUKTUR PROTEINOlehNursal AsbiranStaf Pengajar FK UNBRAH

  • PendahuluanBerbagai fungsi protein dalam tubuh manusia berkaitan dengan struktur protein..Protein katalitik, kekuatan sel untuk hidup, pembentukan makromolekul contoh hubungan struktur dg fungsiseperti batang yang membentuk tulang, gigi, rambu merupakan contoh hubungan struktur dg fungsiUntuk suatu fungsi biologis perlu proses pematangn dengan terjadinya pelipatan polipeptida jadi bentuk 3 dimensi (konformasi), terjadi penambahan gugus kimia baru

  • PendahuluanGenetik dan defisiensi nutrisi mempengaruhi maturasi protien, berdampak negatif pada kesehatan, seperti peny. Alzheimer, bovin spomgioform enchepalopathy (Peny sapi gila)Scurvy disebabkan defisiensi nutrisis pada maturasi protein

  • DefinisiKonformasi, berhubungan dg spasial atom dalam molekulKonfigurasi, hubungan geometri antara atom atom tertentu

  • Klasifikasi protein berdasarkan bentuk Protein globularKompak, sperisRasio panjang/ lebar tidak lebih dari 3.Terbanyak berupa enzim. bermuatan, hidrofilik. Protein fibrous, rasio 10 atau lebih Lipoprotein, glikoprotein mengandung bagian lipid dan karbohidratHemoglobin, mioglobin, sitokrom terikat kuat dengan metal, disebut metalloprotein

  • Terdapat 4 macam struktur proteinStruktur primer urutan asam amino pada rantai polipeptidaStruktur sekunder pelipatan pendek (3 10 AA) polipeptida ke letak geometriStruktur tertierbentuk 3 dimensi struktur sekunder, unit fungsional , polipeptida maturStruktur kuatenerjumlah dan tipe unit polipeptidadari oligoprotein dan susunan ruangnya.

  • Struktur sekunderRotasi bebas hanya tarjadi pada 2 dari 3 ikatan kovalen rangka polipeptida, yaitukarbon alfa dg karbon karbonilkarbon alfa dg nitrogen Ikatan rangkap menghambat rotasiBentuk struktur sekunder, alfa heliksbeta sheetloop & bend

  • Alfa HeliksSatu alfa helikas terbentuk dari 3 -6 aminoasilGugus R menghadap keluarProtein hanya mengandung L AA, sehingga kestabilan hanya bila helis memutar kekananHeliks memutar kekanan yang ada di alam.Alfa heliks predominan hidrofobik, R hidrofilik, shg amfipatik. Sifat amfipatik memungkinkan terbentuk channel atau poros sehingga molekul polar bisa melewati bagian hidrofobik.

  • Beta sheetBentuk plate struktur sekunder, gugus gugus R terletak pada posisi berlawanan Lembar terlipat beta bisa paralel atau anti-paralel

  • Loop & BendSeparuh dari protein globular berupa alfa heliks dan beta sheet, dan separuh lagi berupa loop(gelungan beta), turn, bend (tekukan beta) dan bentuk konformasi lain.Regio gelungan ( loop) membentuk tapak pengikatan antigen.

  • Strukrur tertier dan kuatenerStruktur tertier (ST) merefer ke konformasi 3 adalah satu satu struktur tertier.dimensiSufisien untuk membentuk gugus kimia khusus atau kerja fisik spt berikatan dengan substrat atau gugus lain.Dapat membangun membran sel , atau berinteraksi dengan molekul pengatur.Mioglobin, triosa fosfat isomerase adalah ST tunggal.

  • Struktur tertier dan kuatenerProtein kinase terdiri dari 2 ST mengkatalisis pemindahan fosfat dari ATP ke peprtida atau protein.Bagian amino ujung polipeptida kaya beta sheet, dapat mengikat ATP, sedangkan bagian karboksil ujung yang kaya alfa heliks mengikat peptida atau protein.Adakalanya protein tidak hanya terdiri dari satu polipeptida atau protomer.

  • Struktur kuatener (SK)adalah komposisi polipeptida dari suatu protein untuk membangan protein oligomerik dimana terdapat kaitan antara 2 protomerProtein Monomerik td 1 polipeptidaDimerik td 2 polipetidaDst

  • Faktor yang menstabilkan ST dan SKInteraksi nonkovalen , inter aksi hidrofobik dari rantai samping AA ke bagian dalam protein.Ikatan hidrogen dan ikatan garam antara karboksil aspartat dan glutamat dg muatam berlawanan dari lisil, arginil dan histidilIkatan kovalen (relatif lemah)Ikatan disulfida residu sisteinil

  • DenaturasiPemberian asam atau basa dan pemanasan akan merusak SS, ST dan SKProtein terdenaturasi dapat mengalami renaturasi . Anfinsen berpendapat bahwa struktur primer protein sendiri sudah cukup mengarahkan pelipatan protein.

  • KOLAGEN Melukiskan hubungan struktur dan fungsi yang beragam.Tropokolagen merupakan molekul tripel heliks yg kaya glisin, prolin dan OH-prolin. Setiap residu ke tiga adalah glisinIkatan silang kovalen menstabilkan serabut kolagen Gangguan gizi dan genetik terjadi akibat gangguan SS.

  • Defek kolagenDefisiensi Nutrisi. vitamin C menyebabkan scurvyDefisiensi OH prolin, OH lisinengkakkolagen tak stabil, terjadi perdarahan sendi bengkak, penyembuhan penyakit lama, Bila berat bisa menyebablan kematian.

  • Defek .Sindrom MenkesTerjadi karena defisien Cu, yang dibutuhkan lisil oksidase.Gangguan covalent cross-link (pengencangkan serabut kolagen)Rambut halusGrowth retardasi

  • Defek . Gangguan biosintesis kolagen terjadiosteogenik imperfectatulang fragilSindrom Ehlers Dahlospenyakit jaringan ikatintegritas struktur tak terjadimobil jointSkin abnormalitis

  • TERIMA KASIH