laporan enzim bu mala kel 1

7/28/2019 Laporan Enzim Bu Mala Kel 1

1/48

TRANSFORMASI GEN PENYANDI PROTEIN ENZIM

TRANSGLUTAMINASE DARI BERBAGAI BIOTA PERAIRAN

Disusun oleh

Kelompok 1

La Ode Huli C351120091

Himawan Prasetyo C351120181

Febrina Olivia Akerina C351120111Medal Lintas Perceka C351120121

Ginanjar Pratama C351120131

Astri Nurnaafi C351120141

SEKOLAH PASCASARJANA

INSTITUT PERTANIAN BOGOR

BOGOR

2013


2/48

PENDAHULUAN

Enzim merupakan protein yang berperan sebagai biokatalisator. Seiringdengan meningkatnya industri baik pangan maupun non pangan, enzim semakin

banyak digunakan sebagai biokatalisator. Enzim dapat menurunkan energi

aktivasi sehingga reaksi berjalan lebih cepat. Keuntungan penggunaan enzim

sebagai biokatalisator dibandingankan dengan bahan kimia adalah penggunaannya

sangat spesifik. Enzim hanya mengkatalisis reaksi spesifik. Hal ini dapat

mengurangi efek samping atau reaksi yang tidak diinginkan khususnya dalam

sistem pangan. Penggunaan enzim sebagai biokatalisator juga ramah lingkungan,

sedangkan reaksi menggunakan katalis bahan kimia sering menghasilkan efek

samping/beracun dan tidak ramah lingkungan (Mohamad et al. 2012).

Penggunaan enzim sebagai biokatalisator merupakan green technology yang

penggunaannya harus terus didukung untuk industri pangan. Salah satu enzim

yang bisa dimanfaatkan untuk industri pangan adalah enzim Transglutaminase

(TGase).

Transglutaminase adalah enzim yang dapat membentuk formasi ikatan

silang protein dalam pangan sehingga dapat meningkatkan kualitas tekstur bahan

pangan. Transglutaminase disebut protein glutamine glut amyl transferase dengan

kode EC 2.3.2.1.3. Enzim ini mengkatalisis reaksi transfer gugus asil pada

kelompok -karboksemida pada residu glutaminil dimana ikatan peptida berperan

sebagai kontributor asil (Renzetti et al. 2008).

Transglutaminase merupakan enzim yang dapat mengakatalisis ikatan silang

untuk beberapa jenis protein. Modifikasi pembentukan ikatan silang diantara

protein dengan transglutaminase dapat menghasilkan produk yang memiliki

tekstur lebih baik. Beberapa industri pangan memanfaatkan enzim ini untuk

memperbaiki tekstur keju, mengurangi sineresis (kehilangan air) pada yoghurt,

meningkatkan sifat reologi, enkapsulasi bahan yang berlemak dan larut lemak

serta memperbaiki pembentukan gel dalam protein.

Enzim TGase dapat dihasilkan dari mamalia, tanaman, mikroba, serta biota

laut. Enzim TGase dapat dihasilkn dari biota laut diantaranya red sea bream liver,

Walleye Pollack liver, jaringan daging lobster, scallop, squid, rainbow trout, atcka


3/48

mackerel dengan bobot molekul masing-masing sebesar 78 kDa, 77 kDa, 200

kDa, 80 kDa, 80 kDa, 80 kDa, 80 kDa (Haard dan Simpson 2000).

Analisis bioinformatika adalah penerapan teknik komputasional untuk

mengelola dan menganalisis informasi biologis. Bidang ini mencakup penerapan

metode-metode matematika, statistik, dan informatika untuk memecahkan

masalah-masalah biologis, terutama dengan menggunakan sekuens DNA dan

asam amino serta informasi yang berkaitan dengannya. Topik utama bidang ini

meliputi basis data untuk mengelola informasi biologis. Dalam tulisan ini

dilakukan transformasi fragmen gen penyandi protein yaitu enzim

transglutaminase dari berbagai biota hasil perairan. Analisis yang dilakukan

meliputi translate protein, penentuan bobot molekul, titik isoelektrik, hydropathy

plot, penyejajaran sekuens, analisis filogenik, serta prediksi struktur untuk

meramalkan struktur protein.


4/48

1. Langkah-langkah translate nukleotida enzim transglutaminase dariliver Oncorhynchus keta (chum salmon) menggunakan Program

Bioedit

a. Translate nukleotida menjadi asam aminoLangkah pertama yang dilakukan adalah membuka PUBMED

kemudian pilih resources, pilih DNA&RNA, pilih nukleotida database

dan mencari jenis protein enzim (yang dicari adalah yang sekuens

nukleotidanya komplit, tidak boleh memilih yang parsial)


5/48

File yang telah diperoleh adalah dalam bentuk FASTA file dan disimpan dalam

bentuk notepad


6/48

Program Bioedit dibuka, kemudian open FASTA file transglutaminase ikan chum

salmon

Kemudian lakukan sequence, pilih nucleic acid, pilih translate dan frame 1.

Frame 1 menunjukkan urutan nukleotida yang akan ditranslate menjadi asam

amino dimulai dari nukleotida pertama


7/48

Nukleotida yang telah diterjemahkan menjadi asam amino oleh bioedit kemudian

disimpan filenya. Angka yang tertulis pada bagian samping kanan atas

menunjukkan jumlah nukleotida dan samping kanan bawah menunjukkan jumlah

asam amino.

Jumlah asam

amino

Jumlah

nukleotida


8/48

b. Langkah-langkah penentuan titik isoelektrik dan bobot molekul enzim

transglutaminase chum salmon

Langkah pertama yang dilakukan adalah membuka

http://web.expasy.org/compute_pi/ kemudian submit sekuens asam amino yang

telah diterjemahkan menggunakan bioedit dan pilih click here to compute pI/MW

Hasil yang ditampilkan adalah sebagai berikut

Titik isoelektrik dan

bobot molekul
http://web.expasy.org/compute_pi/http://web.expasy.org/compute_pi/http://web.expasy.org/compute_pi/


9/48

b. Hydropathy plotAnalisis hydropathy plot dilakukan menggunakan tools Kyte and

Doolittle. Langkah pertama yang dilakukan adalah membuka tools

online Kyte and Doolittle, kemudian submit sekuens asam amino

original dari PUBMED.

c. Swiss model.Swissmodel ini merupakan tools untuk memprediksi struktur protein.

Langkah pertama yang dilakukan adalah membuka

http://swissmodel.expasy.org/ kemudian submit sekuens asam amino

enzim transglutaminase original dari PUBMED. Struktur protein dari

enzim transglutaminase dapat diihat pada Gambar di bawah ini.
http://swissmodel.expasy.org/http://swissmodel.expasy.org/http://swissmodel.expasy.org/


10/48

d. Pohon Filogenik (Phylogeny Tree)Untuk membuat pohon pilogenetik dibuat dengan menggunakan

software Mega 4. Dimana minimal banyaknya file yang dimasukkan

adalah 4. Sebelumnya file yang akan dilihat kekerabatannya dibuat

dalam file dengan format MEGA. Awalnya dengan membuka software

mega 4, setelah itu pilih menu alignment, kemudian alignment

search/CLUSTAL pilih create a new alignment. Kemudian masukkan

file berbentuk fasta dengan cara klik edit dan pilih insert sequence

from file, maka file akan secara otomatis muncul dalam software mega

4. Setelah itu file disimpan dengan bentuk Mega. File dengan format

Mega kemudian dapat dibuka untuk dilihat pohon filogeniknya dengan

cara pilih phylogeny, pilih bootstraps test of philogeny, kemudian pilih

neighbour joining. Setelah itu akan muncul pohon filogeniknya.

Langkah-langkahnya dapat dilihat pada gambar-gambar berikut ini :

Gambar Pembuatan Alignment


11/48

Gambar file format Mega yang akan dibuat pohon filogeniknya.

Susunan Nukleotida dan Asam Amino Penyusun Enzim Transglutaminase

dari Berbagai Biota Perairan

a. Susunan nukleotida dan asam amino dari liver ikan chum salmon

(Oncorhynchus keta)

1 ATG ACT GAC CAA AAC GGT GTA TTT ATG GGG ATG GAC CTG CTT TGC 45

1 Met Thr Asp Gln Asn Gly Val Phe Met Gly Met Asp Leu Leu Cys 15

46 CAG GTG AAC AGC CAT GCC CAT CGT ACA GAG GAG ATG GAC GTG GAA 90

16 Gln Val Asn Ser His Ala His Arg Thr Glu Glu Met Asp Val Glu 30

91 AGG CTT CTG GTT CGT CGG GGG CAG CCC TTC TCC CTT GCC TTG CAG 135

31 Arg Leu Leu Val Arg Arg Gly Gln Pro Phe Ser Leu Ala Leu Gln 45

136 TGC CAC ACA ACC CTG CCC CCT AAA CAC AAA CTA GCC ATA ATC TTG 180

46 Cys His Thr Thr Leu Pro Pro Lys His Lys Leu Ala Ile Ile Leu 60

181 CAT CTA GGT AAG GAG GGT GAG GTG GTG GTG AAG GTG TTG GAT GCC 225

61 His Leu Gly Lys Glu Gly Glu Val Val Val Lys Val Leu Asp Ala 75

226 CGT GCT GGC AGG GAC AAG TGG TGG TTC CGC CAG CAG GGG GCT CAG 270

76 Arg Ala Gly Arg Asp Lys Trp Trp Phe Arg Gln Gln Gly Ala Gln 90

271 AGT GAG GTG CTG CTG ACG ATC CAC AGC CCA GCA GAC GCC CCT GTG 315


12/48

91 Ser Glu Val Leu Leu Thr Ile His Ser Pro Ala Asp Ala Pro Val 105

316 GGA CTC TAC AGC GTG ACA GTG CTG CTC CTC TCC CCT GAC GGA CAC 360

106 Gly Leu Tyr Ser Val Thr Val Leu Leu Leu Ser Pro Asp Gly His 120

361 ATC CTG GAG AAG ACA ACA CCA GAG ACG TTC TAC CTG CTC TTC AAC 405

121 Ile Leu Glu Lys Thr Thr Pro Glu Thr Phe Tyr Leu Leu Phe Asn 135

406 CCC TGG TGC AAA GCT GAC TCT GTG TAC CTC CCT GAT GAG GAG CTG 450

136 Pro Trp Cys Lys Ala Asp Ser Val Tyr Leu Pro Asp Glu Glu Leu 150

451 CTA GAG GAG TAC ATC CTG AAT GAA AAT GGC CTC CTT TAC CAG GGT 495

151 Leu Glu Glu Tyr Ile Leu Asn Glu Asn Gly Leu Leu Tyr Gln Gly 165

496 TCC TGG GAC CAG ATT TCC TCA CTA CCC TGG AAC TTT GGA CAG TTT 540

166 Ser Trp Asp Gln Ile Ser Ser Leu Pro Trp Asn Phe Gly Gln Phe 180

541 GAA CAA GAT GTG GTG GAC ATC TGT TTT GAA ATC CTG GAC AAT TCA 585

181 Glu Gln Asp Val Val Asp Ile Cys Phe Glu Ile Leu Asp Asn Ser 195

586 CCT GCT GCA CTG ACA AAC CCA GAG ATG GAC ACA GCC AAC CGA GCA 630

196 Pro Ala Ala Leu Thr Asn Pro Glu Met Asp Thr Ala Asn Arg Ala 210

631 GAC CCA GTG TAC GTG AGC AGG ACA ATT ACT GCC ATG GTG AAC GCT 675211 Asp Pro Val Tyr Val Ser Arg Thr Ile Thr Ala Met Val Asn Ala 225

676 AAT GAT GAC CTT GGC GTG GTG TCG GGC CGT TGG GAC GGG AAG TAC 720

226 Asn Asp Asp Leu Gly Val Val Ser Gly Arg Trp Asp Gly Lys Tyr 240

721 GAT GAC GGG GTG CCG CCC ACA CGT TGG ACT GGC AGT GTG CCC ATC 765

241 Asp Asp Gly Val Pro Pro Thr Arg Trp Thr Gly Ser Val Pro Ile 255

766 CTC AGG CGC TGG AGT GAG GCC GGG GCA CAG AGG GTG CGC TAC GGA 810

256 Leu Arg Arg Trp Ser Glu Ala Gly Ala Gln Arg Val Arg Tyr Gly 270

811 CAG TGC TGG GTG TTT TCA GGC GTA GCC TGT ACA GTT CTT CGC TGT 855

271 Gln Cys Trp Val Phe Ser Gly Val Ala Cys Thr Val Leu Arg Cys 285

856 CTG GGC ATA CCC ACT CGC CCA GTT ACA AAC TAC TCT TCT GCC CAT 900

286 Leu Gly Ile Pro Thr Arg Pro Val Thr Asn Tyr Ser Ser Ala His 300

901 GAC ACT GAT GGC AAC CTG AAT GTG GAC TAT CTG TAT GAT GAG CAG 945

301 Asp Thr Asp Gly Asn Leu Asn Val Asp Tyr Leu Tyr Asp Glu Gln 315


13/48

946 CTG GAG AGT GTG TCT GAA GGC AGG AAG GAC ATG ATC TGG AAC TAC 990

316 Leu Glu Ser Val Ser Glu Gly Arg Lys Asp Met Ile Trp Asn Tyr 330

991 CAT TGC TGG GTG GAG TCC TGG ATG GAC AGG GAG GAT CTT CCT AAA 1035

331 His Cys Trp Val Glu Ser Trp Met Asp Arg Glu Asp Leu Pro Lys 345

1036 GGC TAT GAT GGG TGG CAG GCT CTG GAT CCC ACC CCA CAG GAG AGG 1080

346 Gly Tyr Asp Gly Trp Gln Ala Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu Arg 360

1081 AGT GAT GGG GTG TAC TGT TGT GGG CCC TGT CCA GTG AAG GCA GTG 1125

361 Ser Asp Gly Val Tyr Cys Cys Gly Pro Cys Pro Val Lys Ala Val 375

1126 AGG GAC GGT GAT GTG GGG ATG AAG TAT GAT GCA GCC TTC GTG TTC 1170

376 Arg Asp Gly Asp Val Gly Met Lys Tyr Asp Ala Ala Phe Val Phe 390

1171 TCT GAG GTG AAC GCA GAC CTG GTC ACC TGG ATC GTC CAC CCA GAT 1215

391 Ser Glu Val Asn Ala Asp Leu Val Thr Trp Ile Val His Pro Asp 405

1216 GGC CAA CGC TCA CAG GTT TCC CTC AAC CAG AAT ACA GTG GGC CAA 1260

406 Gly Gln Arg Ser Gln Val Ser Leu Asn Gln Asn Thr Val Gly Gln 420

1261 AAC ATC AGC ACC AAG AGT GTG TAC GGA GAC TAC AGA GAG GAC ATC 1305

421 Asn Ile Ser Thr Lys Ser Val Tyr Gly Asp Tyr Arg Glu Asp Ile 435

1306 ACT AAA CAT TAC AAA TAC CCT GAA GGT TCA GTG AAG GAG CGT GAG 1350

436 Thr Lys His Tyr Lys Tyr Pro Glu Gly Ser Val Lys Glu Arg Glu 450

1351 GTG TAT GAG AAG GCA GGA CGT CAG GTA ACG CAG CCG AAT GGA GCA 1395

451 Val Tyr Glu Lys Ala Gly Arg Gln Val Thr Gln Pro Asn Gly Ala 465

1396 CCA GGG CAG CTG GAG CTG AAG ATC AAA CAC GCC CAG GCC ATC CTG 1440

466 Pro Gly Gln Leu Glu Leu Lys Ile Lys His Ala Gln Ala Ile Leu 480

1441 GGC ACA GAC TTT GAT GTG ATA GTG GAG GTG CAC AAC GTC GGT GGA 1485

481 Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Val Glu Val His Asn Val Gly Gly 495

1486 GAG GAC ACC CCA GCC CAG CTG ACT GTG ACG TCC AAC GCT GTC ACC 1530

496 Glu Asp Thr Pro Ala Gln Leu Thr Val Thr Ser Asn Ala Val Thr 510

1531 TAC AAC AGC CTC CAC CGG GGG GAG TGC CAT AGG AAG ACT GCC AGC 1575

511 Tyr Asn Ser Leu His Arg Gly Glu Cys His Arg Lys Thr Ala Ser 525

1576 CTG ACA GTG CCA GCC CAG AAA GCT CAT AAG GAA GTG CTG CGG CTA 1620

526 Leu Thr Val Pro Ala Gln Lys Ala His Lys Glu Val Leu Arg Leu 540


14/48

1621 CGG TAC GAT CAC TAC GGG GCA TGT GTG TCT GAG CAT AAC CTG ATC 1665

541 Arg Tyr Asp His Tyr Gly Ala Cys Val Ser Glu His Asn Leu Ile 555

1666 AGG GTC ACA GCA CTA CTC CAG GTC AGC GGC CAG CCC GAA GTC GTC 1710

556 Arg Val Thr Ala Leu Leu Gln Val Ser Gly Gln Pro Glu Val Val 570

1711 TTA CAA GAG GTC AAC ATC CAA CTG AGC ATG CCT CAG CTC CAT GTC 1755

571 Leu Gln Glu Val Asn Ile Gln Leu Ser Met Pro Gln Leu His Val 585

1756 AAG GTA GTG GGA GAT GCA GTT GTA TCT CGG AAA TTG ATT GCC CAC 1800

586 Lys Val Val Gly Asp Ala Val Val Ser Arg Lys Leu Ile Ala His 600

1801 ATC AGC TTC ACC AAT CCA CTG CCT ATT ACC CTC AGA GGG GGC GTG 1845

601 Ile Ser Phe Thr Asn Pro Leu Pro Ile Thr Leu Arg Gly Gly Val 615

1846 TTT ACT GTG GAG GGG GCA GGT CTG ACA GCA GCG CGG GAG ATC CAA 1890

616 Phe Thr Val Glu Gly Ala Gly Leu Thr Ala Ala Arg Glu Ile Gln 630

1891 GCA CCA GAT GAC ATT GGA CCA GGT CAA GAG GTC AAG GTC AAG TTG 1935

631 Ala Pro Asp Asp Ile Gly Pro Gly Gln Glu Val Lys Val Lys Leu 645

1936 TCC TTC AAG CCC ACC CGA GCA GGT CTG AGA AAA CTG ATG GTC GAC 1980

646 Ser Phe Lys Pro Thr Arg Ala Gly Leu Arg Lys Leu Met Val Asp 660

1981 TTT GAT GCA GAC AGA ATA AGG GAT GTT AAA GGC ATT GCC ACT TTG 2025

661 Phe Asp Ala Asp Arg Ile Arg Asp Val Lys Gly Ile Ala Thr Leu 675

2026 ATT GTG AGA AAC AAG TGA 2043

676 Ile Val Arg Asn Lys End 681

Hasil translate Bioedit menunjukkan bahwa protein enzim transglutaminase dari

liver chum salmon (Oncorhynchus keta) terdiri dari 2043 nukleotida yang

diterjemahkan menjadi 681 asam amino.

b. Susunan nukleotida dan asam amino dari ikan salmo salar

1 ATG GCT CAA GCA CTG GAC ATT GCC CGA TGG GAC CTG GAG TGT GAG 45

1 Met Ala Gln Ala Leu Asp Ile Ala Arg Trp Asp Leu Glu Cys Glu 15

46 TTC AAC AAC ACA GAC CAC CGT ACG GAG CTC AAC GGG GTG GAG CGC 90

16 Phe Asn Asn Thr Asp His Arg Thr Glu Leu Asn Gly Val Glu Arg 30

91 CTC ATC GTG AGA AGG GGC CAG CCG TTC ACC ATC AAC CTG CAC CTC 135

31 Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Pro Phe Thr Ile Asn Leu His Leu 45


15/48

136 CGC TCG GGC GTC TAC CAG CCT GGT GGC AGC GCC CTT GAC CTC ACC 180

46 Arg Ser Gly Val Tyr Gln Pro Gly Gly Ser Ala Leu Asp Leu Thr 60

181 GTA GAG ACA GGT CCC CAG CCC TCT GAC CAG TAT GGT ACA CAG GCC 225

61 Val Glu Thr Gly Pro Gln Pro Ser Asp Gln Tyr Gly Thr Gln Ala 75

226 TCC TTT GGG CTG ACC GAC CAA ATC GAC ACC TCC CGC TGG AGC GCC 270

76 Ser Phe Gly Leu Thr Asp Gln Ile Asp Thr Ser Arg Trp Ser Ala 90

271 GCC ATC ACC AGT CCC CCC GGG AAC ATG GTG TCC CTG TCC ATC TGT 315

91 Ala Ile Thr Ser Pro Pro Gly Asn Met Val Ser Leu Ser Ile Cys 105

316 TCC CCC CCA GAC GCG CCC ATC GGA CGC TGG CGC CTG ACC CTG GGC 360

106 Ser Pro Pro Asp Ala Pro Ile Gly Arg Trp Arg Leu Thr Leu Gly 120

361 CAG GGG GGC AGG GTG GAC TTT GTG CTG CTC TAT AAC CCC TGG TGC 405

121 Gln Gly Gly Arg Val Asp Phe Val Leu Leu Tyr Asn Pro Trp Cys 135

406 ACC GGT GAT GTG GTG TAC ATG GAC AGT GAG GAG AAA CTG AGG GAG 450

136 Thr Gly Asp Val Val Tyr Met Asp Ser Glu Glu Lys Leu Arg Glu 150

451 TAC ATC TTG GCT CAA GAT GGT ATC ATC TAC CGA GGC GGC TGG AAA 495

151 Tyr Ile Leu Ala Gln Asp Gly Ile Ile Tyr Arg Gly Gly Trp Lys 165

496 TAC CCC ATC CCT ACA CCT TGG AAC TAT GGC CAG TTT GAG GAT GGG 540

166 Tyr Pro Ile Pro Thr Pro Trp Asn Tyr Gly Gln Phe Glu Asp Gly 180

541 ATC CTG AAT GCC TGT CTG AGA ATC CTG GAT ATG AAC CCG AAG TGC 585

181 Ile Leu Asn Ala Cys Leu Arg Ile Leu Asp Met Asn Pro Lys Cys 195

586 CTG CGT AAC CCT GGG AAA GAC GCT TCA GGG AGA AGG AAC CCA ATC 630

196 Leu Arg Asn Pro Gly Lys Asp Ala Ser Gly Arg Arg Asn Pro Ile 210

631 TAT GTG TCC AGA GTC CTC AGT GCC ATG GTG AAC TGC AAT GAC GAC 675

211 Tyr Val Ser Arg Val Leu Ser Ala Met Val Asn Cys Asn Asp Asp 225

676 AAG GGA GTC TTG CTG GGC AGG TGG ACT GAT GAC TAT GAC GGC GGG 720

226 Lys Gly Val Leu Leu Gly Arg Trp Thr Asp Asp Tyr Asp Gly Gly 240

721 GTG AGC CCT CTG TCA TGG AAG GGT AGT GTG GAG ATC CTC CGG AAC 765

241 Val Ser Pro Leu Ser Trp Lys Gly Ser Val Glu Ile Leu Arg Asn 255

766 TGG GAC ACA AAT GCC TGT CAG CCT GTG CGC TTT GGC CAA TGC TGG 810

256 Trp Asp Thr Asn Ala Cys Gln Pro Val Arg Phe Gly Gln Cys Trp 270

811 GTG TTT GCA GCA GTG GCC TGC TCA GTT TCA CGA GCC CTG GGC ATC 855

271 Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Ser Val Ser Arg Ala Leu Gly Ile 285

856 CCT TGT CGA CTG GTC ACC AAC TAC AAT TCA GCC CAC GAC ACC AAC 900

286 Pro Cys Arg Leu Val Thr Asn Tyr Asn Ser Ala His Asp Thr Asn 300

901 AGT AAC CTG GTG ATA GAG CGC TAT GTG GAC GAG AAC GGA CAA CTT 945

301 Ser Asn Leu Val Ile Glu Arg Tyr Val Asp Glu Asn Gly Gln Leu 315

946 GTT CAG ACG TCC AGA GAC ATG ATA TGG AAC TAC CAC TGC TGG GTG 990

316 Val Gln Thr Ser Arg Asp Met Ile Trp Asn Tyr His Cys Trp Val 330

991 GAG AAC TGG ATG ACC AGA CCT GAC CTC AAA CCA GGT TTT GAC GGC 1035

331 Glu Asn Trp Met Thr Arg Pro Asp Leu Lys Pro Gly Phe Asp Gly 345

1036 TGG CAG GTC ATG GAC CCC ACA CCA CAG GAG AAG AGT GAA GGG GTT 1080

346 Trp Gln Val Met Asp Pro Thr Pro Gln Glu Lys Ser Glu Gly Val 360

1081 TAC TGC TGT GGC CCT ATC CCA CTG AAA GCC ATC AAG GAG GGC GAG 1125


16/48

361 Tyr Cys Cys Gly Pro Ile Pro Leu Lys Ala Ile Lys Glu Gly Glu 375

1126 CTC ACC TAT AAA TAT GAC GCC CCA TTT GTG TTT GCG GAG GTC AAT 1170

376 Leu Thr Tyr Lys Tyr Asp Ala Pro Phe Val Phe Ala Glu Val Asn 390

1171 GCT GAC GTG CAC ACC TTC ATG AAG CGC AAA GAT GGC ACC ACG AAG 1215

391 Ala Asp Val His Thr Phe Met Lys Arg Lys Asp Gly Thr Thr Lys 405

1216 AAG ATC ATT AGC TCC GTC CAT GTG GGG CTG AAG ATC AGC ACT AAG 1260

406 Lys Ile Ile Ser Ser Val His Val Gly Leu Lys Ile Ser Thr Lys 420

1261 AGC GTG GGC AGT GAT AGG AGA GAG GAC ATC ACA CAC CTG TAC AAG 1305

421 Ser Val Gly Ser Asp Arg Arg Glu Asp Ile Thr His Leu Tyr Lys 435

1306 TAC CCT GAG GGT TCT GAC GAG GAA AGG GAG GCC TTT ACA AAA GCC 1350

436 Tyr Pro Glu Gly Ser Asp Glu Glu Arg Glu Ala Phe Thr Lys Ala 450

1351 AAC CAC CAG AAC AAA CTA CTG CAG CAG CAA GAC AAT GCT GGC CTG 1395

451 Asn His Gln Asn Lys Leu Leu Gln Gln Gln Asp Asn Ala Gly Leu 465

1396 CTT ATC GTC ATC AAG GTG TCC GCG GAG ATG AGA AAG GGC TGT GAC 1440466 Leu Ile Val Ile Lys Val Ser Ala Glu Met Arg Lys Gly Cys Asp 480

1441 TTT GAC GTG TTT GCC GTG ATT ACA AAC AAC ACG CCC AAT GAG AAG 1485

481 Phe Asp Val Phe Ala Val Ile Thr Asn Asn Thr Pro Asn Glu Lys 495

1486 AAG TGC CGT CTG GTG TTC GGC TCC AGA GCT GTG TCC TAC AAC GGT 1530

496 Lys Cys Arg Leu Val Phe Gly Ser Arg Ala Val Ser Tyr Asn Gly 510

1531 ATT CTG GGA GAG AAC TGT GGG TTC AAA GAC CTG CTC AAC GTA CAG 1575

511 Ile Leu Gly Glu Asn Cys Gly Phe Lys Asp Leu Leu Asn Val Gln 525

1576 TTG GCA CCT GGA GAA GAA AAG CGG GTT GCT CTT AGG ATG AAC TAC 1620

526 Leu Ala Pro Gly Glu Glu Lys Arg Val Ala Leu Arg Met Asn Tyr 540

1621 TCC AAG TAT GCA GAG AAC CTC ACT GAG GAC AAC CTG ATC CGG CTG 1665541 Ser Lys Tyr Ala Glu Asn Leu Thr Glu Asp Asn Leu Ile Arg Leu 555

1666 GCG GCT CTG CTC CTA GAC TAC GGT ACC CAA GAG GCC TAC CTC GCT 1710

556 Ala Ala Leu Leu Leu Asp Tyr Gly Thr Gln Glu Ala Tyr Leu Ala 570

1711 GTG AGG AAC GTC GTA CTG GTT AAC CCC GAG ATC AAA GTC AGG ATC 1755

571 Val Arg Asn Val Val Leu Val Asn Pro Glu Ile Lys Val Arg Ile 585

1756 CTT GGG GAA CCC AAA GAG AAC CGT AAG CTG GCG GCT GAG ATC ACC 1800

586 Leu Gly Glu Pro Lys Glu Asn Arg Lys Leu Ala Ala Glu Ile Thr 600

1801 CTG CAG AAC CCT CTC CCG GTA CCG CTG CAG AAC TGC TGC TTC ACC 1845

601 Leu Gln Asn Pro Leu Pro Val Pro Leu Gln Asn Cys Cys Phe Thr 615

1846 GTG GAG GGG TCC AAT CTC ACT GGA GGA CAG ATC GTC ACT GAA AGA 1890

616 Val Glu Gly Ser Asn Leu Thr Gly Gly Gln Ile Val Thr Glu Arg 630

1891 CTT AAC TCC ACG GTG GAA CCT GGG CAG GAT GCC AAG GTC AAA ATC 1935

631 Leu Asn Ser Thr Val Glu Pro Gly Gln Asp Ala Lys Val Lys Ile 645

1936 TAC TTC ACG CCC ACC CAC TCG GGC CTA AGG AAA CTG GTG GTC GAC 1980

646 Tyr Phe Thr Pro Thr His Ser Gly Leu Arg Lys Leu Val Val Asp 660

1981 TTC GAT AGC AAT AAG TTG TGT CAC GTC AAG GGC TAC AGG AAC GTC 2025

661 Phe Asp Ser Asn Lys Leu Cys His Val Lys Gly Tyr Arg Asn Val 675

2026 ATC ATC GGA AAA TAG 2040

676 Ile Ile Gly Lys End 680


17/48


18/48

811 CCC GTT AAA GTA ACC AGA CAA GCT TCC GCC ATG ATG AAT TCT CAA 855

271 Pro Val Lys Val Thr Arg Gln Ala Ser Ala Met Met Asn Ser Gln 285

856 GAT GAC AAT GGT GTG TTG GTT GGG GAT TGG AGC GGT GAC TAC ATC 900

286 Asp Asp Asn Gly Val Leu Val Gly Asp Trp Ser Gly Asp Tyr Ile 300

901 TAT GGA GTG TCA CCC ACT TCC TGG ACC GGC AGT ACG GAC ATC CTG 945

301 Tyr Gly Val Ser Pro Thr Ser Trp Thr Gly Ser Thr Asp Ile Leu 315

946 ATC AGC TAT GCC AGA AGC AAA GCA CCC GTC CGC TAT GCT CAG TGC 990

316 Ile Ser Tyr Ala Arg Ser Lys Ala Pro Val Arg Tyr Ala Gln Cys 330

991 TGG GTC TAC GCC GGC GTC TTC AAC ACA TTC CTG CGC TGT CTT GGC 1035

331 Trp Val Tyr Ala Gly Val Phe Asn Thr Phe Leu Arg Cys Leu Gly 345

1036 ATC CCG TCT CGT GTT GTG ACC AAC TTC TTC TCT GCA CAC GAC AAT 1080

346 Ile Pro Ser Arg Val Val Thr Asn Phe Phe Ser Ala His Asp Asn 360

1081 GAT GGA AAT CTG AAG ACT GAC ATC ATC TTA GAC GAG AAT GGC AAA 1125

361 Asp Gly Asn Leu Lys Thr Asp Ile Ile Leu Asp Glu Asn Gly Lys 375

1126 ATT GAC AAA AAC CGC ACC AGG GAC TCT GTA TGG AAT TAC CAT TGC 1170

376 Ile Asp Lys Asn Arg Thr Arg Asp Ser Val Trp Asn Tyr His Cys 390

1171 TGG AAT GAG TGC TAC ATG TCT AGG CCT GAC CTC CCC CAG GGC TAT 1215

391 Trp Asn Glu Cys Tyr Met Ser Arg Pro Asp Leu Pro Gln Gly Tyr 405

1216 GGC GGC TGG CAG ATT GTG GAT GCA ACT CCA CAG GAG ACC AGC GAT 1260

406 Gly Gly Trp Gln Ile Val Asp Ala Thr Pro Gln Glu Thr Ser Asp 420

1261 GGT ATG TAC AGA TGT GGA CCA GCA TCA GTC CAT GCA ATC AAA CAC 1305

421 Gly Met Tyr Arg Cys Gly Pro Ala Ser Val His Ala Ile Lys His 435

1306 GGA GAG ATA TGC TTT CCC TAT GAT GCA GCC TTT GTG TTT GCT GAG 1350

436 Gly Glu Ile Cys Phe Pro Tyr Asp Ala Ala Phe Val Phe Ala Glu 450

1351 GTT AAC AGC GAT GTG GTA TTT TAT TCC CGA AGG AGA GAT GGG ACT 1395

451 Val Asn Ser Asp Val Val Phe Tyr Ser Arg Arg Arg Asp Gly Thr 465

1396 TTG GAT CTT GTC AAA GTT AAT CGC ACT CAC ATA GGT CGC ATG GTT 1440

466 Leu Asp Leu Val Lys Val Asn Arg Thr His Ile Gly Arg Met Val 480

1441 TTG ACA AAA GCT CCA GGC GAG GAG ACT CGC CGT GAC ATC ACC AGT 1485

481 Leu Thr Lys Ala Pro Gly Glu Glu Thr Arg Arg Asp Ile Thr Ser 495

1486 CAA TAC AAG TTT CCT GAG GGC AGC GCA GAG GAG AGG ACT GTC CTG 1530

496 Gln Tyr Lys Phe Pro Glu Gly Ser Ala Glu Glu Arg Thr Val Leu 510

1531 GAA AAG GCA GAA GAG TAC GGC TGC AAA CGC GTA AAG GAC AAC CCA 1575

511 Glu Lys Ala Glu Glu Tyr Gly Cys Lys Arg Val Lys Asp Asn Pro 525

1576 TCT CTG GCT GAC GTG GAC CTG ACT CTC CCA ACT CTG GAG ATC AGT 1620

526 Ser Leu Ala Asp Val Asp Leu Thr Leu Pro Thr Leu Glu Ile Ser 540

1621 GTC GGC GAT GAC TTT GAG TTA GAT CTG GAG TTT GTA AAC CAT ACT 1665

541 Val Gly Asp Asp Phe Glu Leu Asp Leu Glu Phe Val Asn His Thr 555

1666 AAG GAG AAG CGA ACA GTG GCG GCT TAC ATC AGT GGG AGC GTA GTT 1710

556 Lys Glu Lys Arg Thr Val Ala Ala Tyr Ile Ser Gly Ser Val Val 570

1711 TAC TAT ACT GGT GTT CCG GCC ATG AGT CCT GTT CAG ACC CCC CAC 1755

571 Tyr Tyr Thr Gly Val Pro Ala Met Ser Pro Val Gln Thr Pro His 585

1756 TGT TCA AAT TGG CCA CAA AAA AGT GTC AAA GAA CTG GTG CAG ATT 1800


19/48

586 Cys Ser Asn Trp Pro Gln Lys Ser Val Lys Glu Leu Val Gln Ile 600

1801 GAG TCA AAA AAG TAC ATG CAG CAC CTG GTG GAA CAG TGC AAC CTC 1845

601 Glu Ser Lys Lys Tyr Met Gln His Leu Val Glu Gln Cys Asn Leu 615

1846 AAC TTT ATT GTA ACA GGG AAG ATC AAA GAG ACG GGA AAG ATT GTC 1890

616 Asn Phe Ile Val Thr Gly Lys Ile Lys Glu Thr Gly Lys Ile Val 630

1891 ACT GCA ACC AAA CTT GTT ACT CTA CAC AAC CCC AAA CTC ACC GTG 1935

631 Thr Ala Thr Lys Leu Val Thr Leu His Asn Pro Lys Leu Thr Val 645

1936 GAG GTG TCT GGA AAC GCC AAA GTG AAT GAA GAG ATG ATG GTG ACT 1980

646 Glu Val Ser Gly Asn Ala Lys Val Asn Glu Glu Met Met Val Thr 660

1981 GTG GAG TTC ACC AAC CCC TTC AGC TTC AGC CTT GAA GAC GTG AAC 2025

661 Val Glu Phe Thr Asn Pro Phe Ser Phe Ser Leu Glu Asp Val Asn 675

2026 GTT CGC ATG GAA GGA CCG GGG GTC ATG TTG CCG AGG CGC AAA ACT 2070

676 Val Arg Met Glu Gly Pro Gly Val Met Leu Pro Arg Arg Lys Thr 690

2071 TTC AGT TTG ATC CTT GGA GGC TCC CAT CTT ACC TGG ACT GAG CTG 2115691 Phe Ser Leu Ile Leu Gly Gly Ser His Leu Thr Trp Thr Glu Leu 705

2116 TTT AGC CCC CAA AGG CCC GGC AAA ACC AGG ATA ATT GCC ACT CTG 2160

706 Phe Ser Pro Gln Arg Pro Gly Lys Thr Arg Ile Ile Ala Thr Leu 720

2161 GAC TGT CCT TCT CTG CGG CAG GTT GAC GGC CAG GTG TCC CTA ACT 2205

721 Asp Cys Pro Ser Leu Arg Gln Val Asp Gly Gln Val Ser Leu Thr 735

2206 GTC GAA CCC TGA 2217

736 Val Glu Pro End 739


Oryzius latipes terdiri dari 2217 nukleotida yang diterjemahkan menjadi 739

asam amino.

d. Susunan nukleotida dan asam amino Thunnus orientali s

1 ATG GCT CAA ACT CTC AAC ATC GAT CGC TGG AAC CTG GAG TGT GAG 45

1 Met Ala Gln Thr Leu Asn Ile Asp Arg Trp Asn Leu Glu Cys Glu 15

46 ATC AAC AAC ACC GAC CAT CGT ACT GAT CTC AAC GGT GTA GAT CGT 90

16 Ile Asn Asn Thr Asp His Arg Thr Asp Leu Asn Gly Val Asp Arg 30

91 CTG ATT GTG AGG AGA GGC CAG CCA TTC ACA ATT AGC CTG TAC CTC 135

31 Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Pro Phe Thr Ile Ser Leu Tyr Leu 45

136 CGC TCA GGG ACA TAC CAA CCT GGA GTC AGC TCT CTT GAC TGC ATT 180

46 Arg Ser Gly Thr Tyr Gln Pro Gly Val Ser Ser Leu Asp Cys Ile 60

181 GCA GAA ACA GGT CCT CAA CCC TAT GAG CAG TAT GGC ACA AGG GCG 225

61 Ala Glu Thr Gly Pro Gln Pro Tyr Glu Gln Tyr Gly Thr Arg Ala 75

226 TCC TTT GGT CTG TCT GCC AAA AAA GAC ACT TCC TGC TGG AGC GCC 270


20/48

76 Ser Phe Gly Leu Ser Ala Lys Lys Asp Thr Ser Cys Trp Ser Ala 90

271 GCT GTC ACC AGT CCC CCT GGA GAA ATG GTG GCC CCG TCT ATC TGC 315

91 Ala Val Thr Ser Pro Pro Gly Glu Met Val Ala Pro Ser Ile Cys 105

316 TCT GCC CCT AAT GCA CAT ATA GGC CGC TAT ACC CTG ACC CTG GGG 360

106 Ser Ala Pro Asn Ala His Ile Gly Arg Tyr Thr Leu Thr Leu Gly 120

361 CAA TCC AGG CAG ATT GAG TTT ATC CTG CTC TTT AAC CCC TGG TGC 405

121 Gln Ser Arg Gln Ile Glu Phe Ile Leu Leu Phe Asn Pro Trp Cys 135

406 CAA GGA GAT GTA GTA TAC ATG GAC AAT GAG AAG AGT TTG GAA GAG 450

136 Gln Gly Asp Val Val Tyr Met Asp Asn Glu Lys Ser Leu Glu Glu 150

451 TAT GTT CTG TCT CAG GAG GGA ATC ATC TTT CGA GGG TCC GAC AAA 495

151 Tyr Val Leu Ser Gln Glu Gly Ile Ile Phe Arg Gly Ser Asp Lys 165

496 CAT CCC ATA CGT AGT CCC TGG AAG ATT GGC CAG AAG GAA ACT GGA 540

166 His Pro Ile Arg Ser Pro Trp Lys Ile Gly Gln Lys Glu Thr Gly 180

541 ATC CTC GAT ATC TGT CTG AGG ATT TTG GAT ATG AAT CCT AAA TGT 585

181 Ile Leu Asp Ile Cys Leu Arg Ile Leu Asp Met Asn Pro Lys Cys 195

586 CTG CGT AAT CCT GGC AAA GAC TGT TCA GGC AGA AGA AAT CCC ATT 630196 Leu Arg Asn Pro Gly Lys Asp Cys Ser Gly Arg Arg Asn Pro Ile 210

631 TAC GTG TCC AGA GTG CTT AGT GCT ATG GTG AAT TGC AAT GAT GAC 675

211 Tyr Val Ser Arg Val Leu Ser Ala Met Val Asn Cys Asn Asp Asp 225

676 AAA GGA GTG GTG CTG GGA AAC TGG ACA GGC AAG TAT GAC GGA GGT 720

226 Lys Gly Val Val Leu Gly Asn Trp Thr Gly Lys Tyr Asp Gly Gly 240

721 GTC AGC CCG ATG TCC TGG AGG GGC AGT GTG GAG ATT TTG CGG AAC 765

241 Val Ser Pro Met Ser Trp Arg Gly Ser Val Glu Ile Leu Arg Asn 255

766 TGG GAC ACA CAG GCC TGT CAG CCT GTT TGC TAC GGA CAG TGC TGG 810

256 Trp Asp Thr Gln Ala Cys Gln Pro Val Cys Tyr Gly Gln Cys Trp 270

811 GTG TTT GCT GCA GTC GCC TGC ACA ATT TCC AGA GCA CTT GGC ATC 855

271 Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr Ile Ser Arg Ala Leu Gly Ile 285

856 CCC TGC AGA GTC GTC ACC AAC TAC TGG TCA GCC CAC GAC AGC AAC 900

286 Pro Cys Arg Val Val Thr Asn Tyr Trp Ser Ala His Asp Ser Asn 300


21/48

901 AGC AAC CTG ATG ATT GAA CGC TAC ATT GAT GAA AAT GGA AAA CTC 945

301 Ser Asn Leu Met Ile Glu Arg Tyr Ile Asp Glu Asn Gly Lys Leu 315

946 TTG AAA TCT GGA GAA ATG ATC TGG AAC TAT CAC TGC TGG GTG GAG 990

316 Leu Lys Ser Gly Glu Met Ile Trp Asn Tyr His Cys Trp Val Glu 330

991 AGC TGG ATG ACC AGG CCT GAC CTT AAA TCT GAT TTT AAT GGC TGG 1035

331 Ser Trp Met Thr Arg Pro Asp Leu Lys Ser Asp Phe Asn Gly Trp 345

1036 CAG GCC AGT GAC CCC ACA CCC CAG GAG AAA AGT GGA GGA GTG TAC 1080

346 Gln Ala Ser Asp Pro Thr Pro Gln Glu Lys Ser Gly Gly Val Tyr 360

1081 TGC TGC GGC CCC GTC CCG CTC AGG GCC ATC AAG GAG GGC GAA CTC 1125

361 Cys Cys Gly Pro Val Pro Leu Arg Ala Ile Lys Glu Gly Glu Leu 375

1126 ACG TTC AAG TAT GAT GCC CCG TTT ATC TTT GCT GAG GTC AAC GCT 1170

376 Thr Phe Lys Tyr Asp Ala Pro Phe Ile Phe Ala Glu Val Asn Ala 390

1171 GAC GTC ATC ACT TTC ATG AAG AGA AAA GAC GGC AGC ACA TCA GAA 1215

391 Asp Val Ile Thr Phe Met Lys Arg Lys Asp Gly Ser Thr Ser Glu 405

1216 GTC ACT ACC TCT ACA GTG GTG GGC CAG AAG ATC AGT ACG AAG AGT 1260

406 Val Thr Thr Ser Thr Val Val Gly Gln Lys Ile Ser Thr Lys Ser 420

1261 GTA GGC AGT GAC GAC AGA GAG GAC ATC ACC CAT CTC TAC AAG TAT 1305

421 Val Gly Ser Asp Asp Arg Glu Asp Ile Thr His Leu Tyr Lys Tyr 435

1306 TCT GAA GGC TCC GCT GAA GAG CGA GCA ACT TTC GAG AAG GCC AAC 1350

436 Ser Glu Gly Ser Ala Glu Glu Arg Ala Thr Phe Glu Lys Ala Asn 450

1351 CAT CAA AAC AAG CTG CTC CAT CAG CAG CAG AAT CAA GGC CTA CAA 1395

451 His Gln Asn Lys Leu Leu His Gln Gln Gln Asn Gln Gly Leu Gln 465

1396 CTC ACT ATC AAA CCC TCA TCA GAG ATG AGG AAG GGC TGC GAC TTT 1440

466 Leu Thr Ile Lys Pro Ser Ser Glu Met Arg Lys Gly Cys Asp Phe 480

1441 GAC GTA TAT GCC GAG GTT ATT AAC AAG ACA GAC AGC GTC AAG AAG 1485

481 Asp Val Tyr Ala Glu Val Ile Asn Lys Thr Asp Ser Val Lys Lys 495

1486 TGC CGC CTG GTG TTT GGA TCC TGT GCT GCG TCC TAC AAT GGG ACT 1530

496 Cys Arg Leu Val Phe Gly Ser Cys Ala Ala Ser Tyr Asn Gly Thr 510

1531 CTG GGA GAG AAT TGT GGC TTT AAA GAT CTG CTC AAT GTT GAA CTC 1575

511 Leu Gly Glu Asn Cys Gly Phe Lys Asp Leu Leu Asn Val Glu Leu 525


22/48

1576 TCA CCA GGA GCA GGG AGG AAG GTC CCA CTA AAG CTG AAC TAT TCT 1620

526 Ser Pro Gly Ala Gly Arg Lys Val Pro Leu Lys Leu Asn Tyr Ser 540

1621 AAG TAC AGT AGC GCA CTC ACT GAG GAC AAC TTA ATC CGT CTG GCT 1665

541 Lys Tyr Ser Ser Ala Leu Thr Glu Asp Asn Leu Ile Arg Leu Ala 555

1666 GCT TTG TTG GTT GAC TAC AGC ACC GGA GAG GCA ACG CTG GCA GTG 1710

556 Ala Leu Leu Val Asp Tyr Ser Thr Gly Glu Ala Thr Leu Ala Val 570

1711 AGA AAC ATT GTA CTG GAT AAT CCT GAG ATC AAA GTC AGA ATC CTG 1755

571 Arg Asn Ile Val Leu Asp Asn Pro Glu Ile Lys Val Arg Ile Leu 585

1756 GGT GAA CCG AAG GAG AAT CGG AAA CTG GCT GCA GAG ATC ACT CTA 1800

586 Gly Glu Pro Lys Glu Asn Arg Lys Leu Ala Ala Glu Ile Thr Leu 600

1801 CAA AAT CCT CTG CCA GAG CCG CTG GAG AAC TGC TGC TTC AGC ATC 1845

601 Gln Asn Pro Leu Pro Glu Pro Leu Glu Asn Cys Cys Phe Ser Ile 615

1846 GAG GGA GCC AAC CTG ACT GGG GGG CGC GCC ATC TCT GAG AGG CTG 1890

616 Glu Gly Ala Asn Leu Thr Gly Gly Arg Ala Ile Ser Glu Arg Leu 630

1891 GGC TCT GCA GTG GGA CCT GGG GAA GAA GTC AAG GCT AAA ATT TAC 1935

631 Gly Ser Ala Val Gly Pro Gly Glu Glu Val Lys Ala Lys Ile Tyr 645

1936 TTC ACT CCC AAC CAT TCT GGG CTG AGA AAG CTG GTG GTC AAC TTC 1980

646 Phe Thr Pro Asn His Ser Gly Leu Arg Lys Leu Val Val Asn Phe 660

1981 GAC AGC AAC AAG CTG TGT CAC GTT AAG GGC TAC AGA AAT GTC ATC 2025

661 Asp Ser Asn Lys Leu Cys His Val Lys Gly Tyr Arg Asn Val Ile 675

2026 ATT GGA AAA TAG 2037

676 Ile Gly Lys End 679


Thunnus orientalis terdiri dari 2037 nukleotida yang diterjemahkan menjadi 679

asam amino.

e. Susunan nukleotida dan asam amino Oreochromisniloticus

1 ATG GCC AAC CAC AAA GGT TTG ATT AGT GAT GTG GAT CTC AGA AGT 45

1 Met Ala Asn His Lys Gly Leu Ile Ser Asp Val Asp Leu Arg Ser 15


23/48

46 CGC GAG AAC AAC TCG GCA CAC CAC ACC AGG GAG ATC GAT CAA AAG 90

16 Arg Glu Asn Asn Ser Ala His His Thr Arg Glu Ile Asp Gln Lys 30

91 CGT TTG ATT GTC CGT AGG GGT CAG CCC TTC TCC ATC ACT CTG CAG 135

31 Arg Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Pro Phe Ser Ile Thr Leu Gln 45

136 TGT AAT GGC TCT TTG CGC CCC AGA CAC CAC TTG GAT CTG GTC CTG 180

46 Cys Asn Gly Ser Leu Arg Pro Arg His His Leu Asp Leu Val Leu 60

181 CAC CTC GGT AAG AGA GAC GAG GTG GAG ATC AAG GTT CAG AAG GAG 225

61 His Leu Gly Lys Arg Asp Glu Val Glu Ile Lys Val Gln Lys Glu 75

226 CGT GGA GCT GGG GAC AAG TGG TGG TTT AAC CAG CAG GGA GCA CAA 270

76 Arg Gly Ala Gly Asp Lys Trp Trp Phe Asn Gln Gln Gly Ala Gln 90

271 GAT GAA ATG CTG CTG ACT CTG CAC AGT CCA GCT GAT GCT ATA ATT 315

91 Asp Glu Met Leu Leu Thr Leu His Ser Pro Ala Asp Ala Ile Ile 105

316 GGC CGG TAC AGT CTG GCT GTG CTG CTG ATG TCA CCG GAC GGA CGC 360

106 Gly Arg Tyr Ser Leu Ala Val Leu Leu Met Ser Pro Asp Gly Arg 120

361 ATT TTA GAG AAA AAG GAC AAA ATG AGT TTC CAC CTG CTC TAT AAC 405121 Ile Leu Glu Lys Lys Asp Lys Met Ser Phe His Leu Leu Tyr Asn 135

406 CCC TGG TGC AAA GAT GAT GTG GTG TAC CTG CCC GAC GAG ACG CAG 450

136 Pro Trp Cys Lys Asp Asp Val Val Tyr Leu Pro Asp Glu Thr Gln 150

451 CTT CAG GAG TAC ATC ATG AAC GAA GAC GGA ATA ATC TAC ATG GGG 495

151 Leu Gln Glu Tyr Ile Met Asn Glu Asp Gly Ile Ile Tyr Met Gly 165

496 ACC TGG GAA TAC ATC AAA AGC ACT CAC TGG AAT TAT GGA CAG TTT 540

166 Thr Trp Glu Tyr Ile Lys Ser Thr His Trp Asn Tyr Gly Gln Phe 180

541 GAG GAC TAT GTG ATG GAC ATC TGT TTT GAA GTC CTG AAT AAC TCC 585

181 Glu Asp Tyr Val Met Asp Ile Cys Phe Glu Val Leu Asn Asn Ser 195

586 AAC GAT GCT CTG CGA AAC TCA CAG ATG GAC ATT GAG CAG AGA TTT 630

196 Asn Asp Ala Leu Arg Asn Ser Gln Met Asp Ile Glu Gln Arg Phe 210

631 GAC CCC GTC TAT GTC AGC AGG ATC ATC GCT GCA ATG GTG AAC TCT 675

211 Asp Pro Val Tyr Val Ser Arg Ile Ile Ala Ala Met Val Asn Ser 225


24/48

676 AAT GAT GAC AGA GGA GTG CTG ACT GGG CGC TGG ACT GAG CCG TAC 720

226 Asn Asp Asp Arg Gly Val Leu Thr Gly Arg Trp Thr Glu Pro Tyr 240

721 TCT GAT GGA GTT GCA CCG TAC CAG TGG ACC GGC AGC GTA CCG ATC 765

241 Ser Asp Gly Val Ala Pro Tyr Gln Trp Thr Gly Ser Val Pro Ile 255

766 CTC CGT CAG TGG AGC AAA GCT GGG GTC AGA GCA GTG AAA TAT GGC 810

256 Leu Arg Gln Trp Ser Lys Ala Gly Val Arg Ala Val Lys Tyr Gly 270

811 CAG TGC TGG GTG TTT GCT GCT GTT GCA TGT ACA GTG CTG CGC TGT 855

271 Gln Cys Trp Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr Val Leu Arg Cys 285

856 CTG GGA ATC CCA ACA CGC CTC ATC ACC AAC TTC TCC TCA GCT CAT 900

286 Leu Gly Ile Pro Thr Arg Leu Ile Thr Asn Phe Ser Ser Ala His 300

901 GAT GTC GAT GGA AAC CCC TCT ATA GAC TTC CTG TTG GAT GAA AAC 945

301 Asp Val Asp Gly Asn Pro Ser Ile Asp Phe Leu Leu Asp Glu Asn 315

946 CTG CAA CCA TTG GAG AGC AGA GGA GGG AGA GAC AGC AGC TGG AAT 990

316 Leu Gln Pro Leu Glu Ser Arg Gly Gly Arg Asp Ser Ser Trp Asn 330

991 TTC CAC TGC TGG GTG GAG TCT TGG ATG AGG AGA GAT GAT CTC CCC 1035

331 Phe His Cys Trp Val Glu Ser Trp Met Arg Arg Asp Asp Leu Pro 345

1036 AAA GGA AAT GAT GGC TGG CAG GTT TTA GAT CCC ACC CCT CAA GAA 1080

346 Lys Gly Asn Asp Gly Trp Gln Val Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu 360

1081 CTC AGC AAT GGG GTT TTC CGC TGT GGT CCG TGC CCT GTG ACA GCC 1125

361 Leu Ser Asn Gly Val Phe Arg Cys Gly Pro Cys Pro Val Thr Ala 375

1126 ATC AAG GAG GGA AAT CTG GGA GTG AAG TAC GAT GCT CCG TTT GTG 1170

376 Ile Lys Glu Gly Asn Leu Gly Val Lys Tyr Asp Ala Pro Phe Val 390

1171 TTT GCA GAG GTG AAC GCT GAC ATC ATC CAC TGG ATC GTT CAG AGA 1215

391 Phe Ala Glu Val Asn Ala Asp Ile Ile His Trp Ile Val Gln Arg 405

1216 AAT GGC CAA CGG AGA AAA ATC AGA GTG GAC CAT GCC ACT GTG GGT 1260

406 Asn Gly Gln Arg Arg Lys Ile Arg Val Asp His Ala Thr Val Gly 420

1261 AGG AAC ATC AGC ACC AAA AGT GTT TAT GGG GAC TTC AGA GAT GAT 1305

421 Arg Asn Ile Ser Thr Lys Ser Val Tyr Gly Asp Phe Arg Asp Asp 435

1306 GTC ACT CTG CAC TAC AAA TAT CCT GAA GGA TCC AAG AAG GAG AGA 1350

436 Val Thr Leu His Tyr Lys Tyr Pro Glu Gly Ser Lys Lys Glu Arg 450


25/48

1351 GAA GTG TAC GAG AAG GCG GGG CGT CGG GTG ACA GAT GTC CCC AGT 1395

451 Glu Val Tyr Glu Lys Ala Gly Arg Arg Val Thr Asp Val Pro Ser 465

1396 GAG AGC TCA GAA CCA GGA CGA CTG CAG CTG TCC ATC AAG CAT GCC 1440

466 Glu Ser Ser Glu Pro Gly Arg Leu Gln Leu Ser Ile Lys His Ala 480

1441 AAG CCT GTG TTT GGG ACA GAC TTT GAT GTG ATT ATT GAG GTG AAG 1485

481 Lys Pro Val Phe Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Ile Glu Val Lys 495

1486 AAT GAA GGA GAC CAG GAT GCT CAT GTT CAG CTG ACC ATG CTG GCT 1530

496 Asn Glu Gly Asp Gln Asp Ala His Val Gln Leu Thr Met Leu Ala 510

1531 ATG GCT GTT ACT TAC AGC TCT CTT CAT CGG GGG AAC TGC CAG AGG 1575

511 Met Ala Val Thr Tyr Ser Ser Leu His Arg Gly Asn Cys Gln Arg 525

1576 CAG ACC ACC ACT GTG ATG GTG CCT GCT CAC AAA GCT CAG CAG GAA 1620

526 Gln Thr Thr Thr Val Met Val Pro Ala His Lys Ala Gln Gln Glu 540

1621 GTG CTG CGT CTG CGC TAC GAT GAC TAT GCC CAG TGT GTC TCA GAC 1665

541 Val Leu Arg Leu Arg Tyr Asp Asp Tyr Ala Gln Cys Val Ser Asp 555

1666 GAT CAT CTG ATC AGG GTG AAA GCA TTT GTA GAG GCT CCA GGC GAG 1710

556 Asp His Leu Ile Arg Val Lys Ala Phe Val Glu Ala Pro Gly Glu 570

1711 AAC GAG CCC CTC CTG ACT GTG ACT GAC ATC CCA CTC AGC AGA CCT 1755

571 Asn Glu Pro Leu Leu Thr Val Thr Asp Ile Pro Leu Ser Arg Pro 585

1756 GAA GTC TTC ATA CAG GTT CCT GGG AGG GCT TTT GTT TGT GAA CAA 1800

586 Glu Val Phe Ile Gln Val Pro Gly Arg Ala Phe Val Cys Glu Gln 600

1801 GTA AAA GCT TCC ATC TCC TTC ACC AAT CCG TTA CCA GTT CCA CTG 1845

601 Val Lys Ala Ser Ile Ser Phe Thr Asn Pro Leu Pro Val Pro Leu 615

1846 AAA GGA GGT GTG TTC ACT CTG GAG GGT GCA GGC CTA CTC TCT TCC 1890

616 Lys Gly Gly Val Phe Thr Leu Glu Gly Ala Gly Leu Leu Ser Ser 630

1891 ACT AAG ATC CAT GTT AGT GGG GAC ATT TCT CCA GGA CAG ACG GTG 1935

631 Thr Lys Ile His Val Ser Gly Asp Ile Ser Pro Gly Gln Thr Val 645

1936 TCC ATT GTG GTG TCC TTC TCA CCC ATG AGG ACT GGG GTG AGG AAG 1980

646 Ser Ile Val Val Ser Phe Ser Pro Met Arg Thr Gly Val Arg Lys 660

1981 CTG CTG GTG GAC TTT GAC TCT GAC CGA CTG AAA GAT GTA AAG GGA 2025


26/48

661 Leu Leu Val Asp Phe Asp Ser Asp Arg Leu Lys Asp Val Lys Gly 675

2026 GTC ACC ACT GTG GTC GTC CGC AAG AAG TAC AGA AAT ATC TTC CCT 2070

676 Val Thr Thr Val Val Val Arg Lys Lys Tyr Arg Asn Ile Phe Pro 690

2071 GAA ATT ACT GAA TGT TAT TAA 2091

691 Glu Ile Thr Glu Cys Tyr End 697


Oreochromis niloticus terdiri dari 2091 nukleotida yang diterjemahkan menjadi

697 asam amino.

f. Susunan nukleotida dan asam amino Cypri nus carpio1 ATG GCT CTG GAC ATC GGC ACC TGG GAT CTG GCG TGT CAG TTC AAT 45

1 Met Ala Leu Asp Ile Gly Thr Trp Asp Leu Ala Cys Gln Phe Asn 15

46 AAC ACG GAT CAC CAC ACG GAG CTG AAC GGC ACG GAT CGG CTG ATC 90

16 Asn Thr Asp His His Thr Glu Leu Asn Gly Thr Asp Arg Leu Ile 30

91 GTA CGG AGA GGA CAG GCC TTC ACC ATC AAC CTG TAC CTG AAC TCT 135

31 Val Arg Arg Gly Gln Ala Phe Thr Ile Asn Leu Tyr Leu Asn Ser 45

136 GGC TCT TAC CAG CCC GGA TAC AGT CAG CTG CAT ATC ACT GCA GAG 180

46 Gly Ser Tyr Gln Pro Gly Tyr Ser Gln Leu His Ile Thr Ala Glu 60

181 ACA GGC CCT CAG CCT GAG GAG CAG TAT GGC ACC AGA GCC GTG TTG 225

61 Thr Gly Pro Gln Pro Glu Glu Gln Tyr Gly Thr Arg Ala Val Leu 75

226 GGC CTC AGC GAT GAG ATC GAC GAC ACG CGC TGG AGT GCA GGC GTC 270

76 Gly Leu Ser Asp Glu Ile Asp Asp Thr Arg Trp Ser Ala Gly Val 90

271 AGC AGT CCG TCC GGA GAC ACT GTT TGT CTT TCT GTC TGC GCC GCT 315

91 Ser Ser Pro Ser Gly Asp Thr Val Cys Leu Ser Val Cys Ala Ala 105

316 CCT GAC GCT CCC ATC GGC CGG TAC GTC CTG ACT CTA GAT GGG CAC 360

106 Pro Asp Ala Pro Ile Gly Arg Tyr Val Leu Thr Leu Asp Gly His 120

361 ATC CAG TTC GAC TTT ATT CTG CTC TTC AAT CCC TGG TGC CCA AGA 405

121 Ile Gln Phe Asp Phe Ile Leu Leu Phe Asn Pro Trp Cys Pro Arg 135

406 GAT GTG GTC TAC ATG GAC AGC GAG GAG AAG CTG GCC GAG TAC GTT 450

136 Asp Val Val Tyr Met Asp Ser Glu Glu Lys Leu Ala Glu Tyr Val 150

451 CTG GCC CAG GAT GGG ATC ATC TTC AGG GGC GAT GTC GAA TAC CCA 495

151 Leu Ala Gln Asp Gly Ile Ile Phe Arg Gly Asp Val Glu Tyr Pro 165

496 GTC CCT TTG GCC TGG TAT TTT GGA CAG TTT GAG GAG GGC ATA CTG 540

166 Val Pro Leu Ala Trp Tyr Phe Gly Gln Phe Glu Glu Gly Ile Leu 180

541 GAT GCT TGT TTG AGA ATC CTG GAC ATG AAC CCT AAA CAC AGT AGG 585

181 Asp Ala Cys Leu Arg Ile Leu Asp Met Asn Pro Lys His Ser Arg 195

586 AAC CCT GGG AAG GAC TGT TCT GGA CGC AGA AAC GTC ATT TAT GTC 630

196 Asn Pro Gly Lys Asp Cys Ser Gly Arg Arg Asn Val Ile Tyr Val 210


27/48


28/48

1621 CAA TAC TGC AAC AAT CTA ACA GAG GAC AAT CTC ATC CGT CTG GGC 1665

541 Gln Tyr Cys Asn Asn Leu Thr Glu Asp Asn Leu Ile Arg Leu Gly 555

1666 GCT CTG CTG ATC GAC TGC AGC ACC AAG GAA GCT GTC ATG GCC ATG 1710

556 Ala Leu Leu Ile Asp Cys Ser Thr Lys Glu Ala Val Met Ala Met 570

1711 CGT GAC ATC GTG TTG GAC GAC CCC GAG ATC AAA ATC AGG ATT CTG 1755

571 Arg Asp Ile Val Leu Asp Asp Pro Glu Ile Lys Ile Arg Ile Leu 585

1756 GGA GAA CCC AAA GAG AAG CGT AAG CTG GCG GCG GAG CTC ACT TTA 1800

586 Gly Glu Pro Lys Glu Lys Arg Lys Leu Ala Ala Glu Leu Thr Leu 600

1801 CAG AAC CCA CTG CCA GAA ACC TTA CAA GGC TGC TGC TTC ACC ATC 1845

601 Gln Asn Pro Leu Pro Glu Thr Leu Gln Gly Cys Cys Phe Thr Ile 615

1846 GAG GGC GCA AAC CTC ACC GGC AGC AGC ATC ACC GAG AAA CTG GAG 1890

616 Glu Gly Ala Asn Leu Thr Gly Ser Ser Ile Thr Glu Lys Leu Glu 630

1891 TCA CCC ATC GAA CCC GGG CAG GAG GCA AAA GTC ATC ATG TAC TTC 1935

631 Ser Pro Ile Glu Pro Gly Gln Glu Ala Lys Val Ile Met Tyr Phe 645

1936 ACT CCC ACT CAG TCA GGC CTC TGC AAA CTC GTG GTG GAT TTT GAC 1980

646 Thr Pro Thr Gln Ser Gly Leu Cys Lys Leu Val Val Asp Phe Asp 660

1981 AGC GAC AAG CTG GGC CAT GTT AGA GGA TAC AAG AAC GTT ATC ATC 2025

661 Ser Asp Lys Leu Gly His Val Arg Gly Tyr Lys Asn Val Ile Ile 675

2026 GGG AAA TGA 2034

676 Gly Lys End 678


Cyprinus carpio terdiri dari 2034 nukleotida yang diterjemahkan menjadi 678

asam amino.

Titik Isoelektrik dan Bobot Molekul Enzim Transglutaminase dari Berbagai

Biota Perairan

Titik isoelektrik dan bobot molekul enzim transglutaminase dari berbagai biota

perairan dapat dilihat pada tabel di bawah ini.

Spesies Biota Titik Isoelektrik Bobot Molekuk (Dalton)

LiverOncorhynchus keta 9,33 228814,21

Salmo Salar 9,01 229980,30

Oryzias latipes 9,58 251179,48

Thunnus orientalis 8,67 231075,93

Oreochromis niloticus 9,06 234333,63

Cyprinus carpio 8,54 230379,26


29/48

1. Liver chum salmon (Oncorhynchus keta)

10 20 30 40 50 60

METALAGLNA LALEUASPIL EALAARGTRP ASPLEUGLUC YSGLUPHEAS NASNTHRASP

70 80 90 100 110 120

HISARGTHRG LULEUASNGL YVALGLUARG LEUILEVALA RGARGGLYGL NPROPHETHR

130 140 150 160 170 180

ILEASNLEUH ISLEUARGSE RGLYVALTYR GLNPROGLYG LYSERALALE UASPLEUTHR

190 200 210 220 230 240

VALGLUTHRG LYPROGLNPR OSERASPGLN TYRGLYTHRG LNALASERPH EGLYLEUTHR

250 260 270 280 290 300

ASPGLNILEA SPTHRSERAR GTRPSERALA ALAILETHRS ERPROPROGL YASNMETVAL

310 320 330 340 350 360

SERLEUSERI LECYSSERPR OPROASPALA PROILEGLYA RGTRPARGLE UTHRLEUGLY

370 380 390 400 410 420

GLNGLYGLYA RGVALASPPH EVALLEULEU TYRASNPROT RPCYSTHRGL YASPVALVAL

430 440 450 460 470 480

TYRMETASPS ERGLUGLULY SLEUARGGLU TYRILELEUA LAGLNASPGL YILEILETYR

490 500 510 520 530 540

ARGGLYGLYT RPLYSTYRPR OILEPROTHR PROTRPASNT YRGLYGLNPH EGLUASPGLY

550 560 570 580 590 600

ILELEUASNA LACYSLEUAR GILELEUASP METASNPROL YSCYSLEUAR GASNPROGLY

610 620 630 640 650 660

LYSASPALAS ERGLYARGAR GASNPROILE TYRVALSERA RGVALLEUSE RALAMETVAL

670 680 690 700 710 720

ASNCYSASNA SPASPLYSGL YVALLEULEU GLYARGTRPT HRASPASPTY RASPGLYGLY

730 740 750 760 770 780

VALSERPROL EUSERTRPLY SGLYSERVAL GLUILELEUA RGASNTRPAS PTHRASNALA

790 800 810 820 830 840

CYSGLNPROV ALARGPHEGL YGLNCYSTRP VALPHEALAA LAVALALACY SSERVALSER

850 860 870 880 890 900

ARGALALEUG LYILEPROCY SARGLEUVAL THRASNTYRA SNSERALAHI SASPTHRASN

910 920 930 940 950 960

SERASNLEUV ALILEGLUAR GTYRVALASP GLUASNGLYG LNLEUVALGL NTHRSERARG

970 980 990 1000 1010 1020

ASPMETILET RPASNTYRHI SCYSTRPVAL GLUASNTRPM ETTHRARGPR OASPLEULYS

1030 1040 1050 1060 1070 1080

PROGLYPHEA SPGLYTRPGL NVALMETASP PROTHRPROG LNGLULYSSE RGLUGLYVAL

1090 1100 1110 1120 1130 1140

TYRCYSCYSG LYPROILEPR OLEULYSALA ILELYSGLUG LYGLULEUTH RTYRLYSTYR


30/48

1150 1160 1170 1180 1190 1200

ASPALAPROP HEVALPHEAL AGLUVALASN ALAASPVALH ISTHRPHEME TLYSARGLYS

1210 1220 1230 1240 1250 1260

ASPGLYTHRT HRLYSLYSIL EILESERSER VALHISVALG LYLEULYSIL ESERTHRLYS

1270 1280 1290 1300 1310 1320

SERVALGLYS ERASPARGAR GGLUASPILE THRHISLEUT YRLYSTYRPR OGLUGLYSER

1330 1340 1350 1360 1370 1380

ASPGLUGLUA RGGLUALAPH ETHRLYSALA ASNHISGLNA SNLYSLEULE UGLNGLNGLN

1390 1400 1410 1420 1430 1440

ASPASNALAG LYLEULEUIL EVALILELYS VALSERALAG LUMETARGLY SGLYCYSASP

1450 1460 1470 1480 1490 1500

PHEASPVALP HEALAVALIL ETHRASNASN THRPROASNG LULYSLYSCY SARGLEUVAL

1510 1520 1530 1540 1550 1560

PHEGLYSERA RGALAVALSE RTYRASNGLY ILELEUGLYG LUASNCYSGL YPHELYSASP

1570 1580 1590 1600 1610 1620

LEULEUASNV ALGLNLEUAL APROGLYGLU GLULYSARGV ALALALEUAR GMETASNTYR

1630 1640 1650 1660 1670 1680

SERLYSTYRA LAGLUASNLE UTHRGLUASP ASNLEUILEA RGLEUALAAL ALEULEULEU

1690 1700 1710 1720 1730 1740

ASPTYRGLYT HRGLNGLUAL ATYRLEUALA VALARGASNV ALVALLEUVA LASNPROGLU

1750 1760 1770 1780 1790 1800ILELYSVALA RGILELEUGL YGLUPROLYS GLUASNARGL YSLEUALAAL AGLUILETHR

1810 1820 1830 1840 1850 1860

LEUGLNASNP ROLEUPROVA LPROLEUGLN ASNCYSCYSP HETHRVALGL UGLYSERASN

1870 1880 1890 1900 1910 1920

LEUTHRGLYG LYGLNILEVA LTHRGLUARG LEUASNSERT HRVALGLUPR OGLYGLNASP

1930 1940 1950 1960 1970 1980

ALALYSVALL YSILETYRPH ETHRPROTHR HISSERGLYL EUARGLYSLE UVALVALASP

1990 2000 2010 2020 2030 2040

PHEASPSERA SNLYSLEUCY SHISVALLYS GLYTYRARGA SNVALILEIL EGLYLYSEND

2. Salmo Salar

10 20 30 40 50 60

METALAGLNA LALEUASPIL EALAARGTRP ASPLEUGLUC YSGLUPHEAS NASNTHRASP

70 80 90 100 110 120

HISARGTHRG LULEUASNGL YVALGLUARG LEUILEVALA RGARGGLYGL NPROPHETHR

130 140 150 160 170 180

ILEASNLEUH ISLEUARGSE RGLYVALTYR GLNPROGLYG LYSERALALE UASPLEUTHR


31/48

190 200 210 220 230 240

VALGLUTHRG LYPROGLNPR OSERASPGLN TYRGLYTHRG LNALASERPH EGLYLEUTHR

250 260 270 280 290 300

ASPGLNILEA SPTHRSERAR GTRPSERALA ALAILETHRS ERPROPROGL YASNMETVAL

310 320 330 340 350 360

SERLEUSERI LECYSSERPR OPROASPALA PROILEGLYA RGTRPARGLE UTHRLEUGLY

370 380 390 400 410 420

GLNGLYGLYA RGVALASPPH EVALLEULEU TYRASNPROT RPCYSTHRGL YASPVALVAL

430 440 450 460 470 480

TYRMETASPS ERGLUGLULY SLEUARGGLU TYRILELEUA LAGLNASPGL YILEILETYR

490 500 510 520 530 540

ARGGLYGLYT RPLYSTYRPR OILEPROTHR PROTRPASNT YRGLYGLNPH EGLUASPGLY

550 560 570 580 590 600ILELEUASNA LACYSLEUAR GILELEUASP METASNPROL YSCYSLEUAR GASNPROGLY

610 620 630 640 650 660

LYSASPALAS ERGLYARGAR GASNPROILE TYRVALSERA RGVALLEUSE RALAMETVAL

670 680 690 700 710 720

ASNCYSASNA SPASPLYSGL YVALLEULEU GLYARGTRPT HRASPASPTY RASPGLYGLY

730 740 750 760 770 780

VALSERPROL EUSERTRPLY SGLYSERVAL GLUILELEUA RGASNTRPAS PTHRASNALA

790 800 810 820 830 840

CYSGLNPROV ALARGPHEGL YGLNCYSTRP VALPHEALAA LAVALALACY SSERVALSER

850 860 870 880 890 900

ARGALALEUG LYILEPROCY SARGLEUVAL THRASNTYRA SNSERALAHI SASPTHRASN

910 920 930 940 950 960

SERASNLEUV ALILEGLUAR GTYRVALASP GLUASNGLYG LNLEUVALGL NTHRSERARG

970 980 990 1000 1010 1020

ASPMETILET RPASNTYRHI SCYSTRPVAL GLUASNTRPM ETTHRARGPR OASPLEULYS

1030 1040 1050 1060 1070 1080

PROGLYPHEA SPGLYTRPGL NVALMETASP PROTHRPROG LNGLULYSSE RGLUGLYVAL

1090 1100 1110 1120 1130 1140

TYRCYSCYSG LYPROILEPR OLEULYSALA ILELYSGLUG LYGLULEUTH RTYRLYSTYR

1150 1160 1170 1180 1190 1200

ASPALAPROP HEVALPHEAL AGLUVALASN ALAASPVALH ISTHRPHEME TLYSARGLYS

1210 1220 1230 1240 1250 1260

ASPGLYTHRT HRLYSLYSIL EILESERSER VALHISVALG LYLEULYSIL ESERTHRLYS

1270 1280 1290 1300 1310 1320

SERVALGLYS ERASPARGAR GGLUASPILE THRHISLEUT YRLYSTYRPR OGLUGLYSER

1330 1340 1350 1360 1370 1380

ASPGLUGLUA RGGLUALAPH ETHRLYSALA ASNHISGLNA SNLYSLEULE UGLNGLNGLN


32/48

1390 1400 1410 1420 1430 1440

ASPASNALAG LYLEULEUIL EVALILELYS VALSERALAG LUMETARGLY SGLYCYSASP

1450 1460 1470 1480 1490 1500

PHEASPVALP HEALAVALIL ETHRASNASN THRPROASNG LULYSLYSCY SARGLEUVAL

1510 1520 1530 1540 1550 1560

PHEGLYSERA RGALAVALSE RTYRASNGLY ILELEUGLYG LUASNCYSGL YPHELYSASP

1570 1580 1590 1600 1610 1620

LEULEUASNV ALGLNLEUAL APROGLYGLU GLULYSARGV ALALALEUAR GMETASNTYR

1630 1640 1650 1660 1670 1680

SERLYSTYRA LAGLUASNLE UTHRGLUASP ASNLEUILEA RGLEUALAAL ALEULEULEU

1690 1700 1710 1720 1730 1740

ASPTYRGLYT HRGLNGLUAL ATYRLEUALA VALARGASNV ALVALLEUVA LASNPROGLU

1750 1760 1770 1780 1790 1800

ILELYSVALA RGILELEUGL YGLUPROLYS GLUASNARGL YSLEUALAAL AGLUILETHR

1810 1820 1830 1840 1850 1860

LEUGLNASNP ROLEUPROVA LPROLEUGLN ASNCYSCYSP HETHRVALGL UGLYSERASN

1870 1880 1890 1900 1910 1920

LEUTHRGLYG LYGLNILEVA LTHRGLUARG LEUASNSERT HRVALGLUPR OGLYGLNASP

1930 1940 1950 1960 1970 1980

ALALYSVALL YSILETYRPH ETHRPROTHR HISSERGLYL EUARGLYSLE UVALVALASP

1990 2000 2010 2020 2030 2040PHEASPSERA SNLYSLEUCY SHISVALLYS GLYTYRARGA SNVALILEIL EGLYLYSEND

3. Oryzias latipes

10 20 30 40 50 60

METSERASPT HRSERALATH RPROTHRSER PROPROALAP ROTHRPROTH RPROSERLYS

70 80 90 100 110 120

GLYASNARGA RGGLYARGLY SALAGLYPRO ALAASPASNS ERASNSERGL UPHEALAASN

130 140 150 160 170 180PHEPROGLUV ALGLUTYRPH EILEALAPRO GLYPROARGG LYTYRPROPR OLEUTHRGLU

190 200 210 220 230 240

PHELEUASPI LETRPASPVA LASPMETILE ARGARGILEA SPGLUSERAS NLYSLEUGLU

250 260 270 280 290 300

HISHISTHRG LULEUTYRAS NSERGLUASN LEUILEVALA RGARGGLYGL NGLUPHEGLN

310 320 330 340 350 360

ILELYSLEUT HRPHEASNAR GPROTYRLYS PROASPGLUA SPLYSPHEAL AVALGLUPHE

370 380 390 400 410 420

THRILEGLYS ERSERPROGL NPHESERLYS GLYTHRTYRI LEPROVALPH EPHETHRLYS


33/48

430 440 450 460 470 480

GLUARGGLNS ERSERTRPAL AGLYARGALA ILEALAASNS ERASPASNIL EVALTHRVAL

490 500 510 520 530 540

GLYILETHRP ROALATHRAS NCYSILEVAL GLYLYSTYRA SNLEUTYRVA LALAVALVAL

550 560 570 580 590 600

THRPROTYRG LYVALARGAR GGLNARGPRO ASPLYSSERA RGGLUMETTY RILELEUPHE

610 620 630 640 650 660

ASNPROTRPA LALYSASPAS PALALEUASP ASPGLUMETG LUARGGLNGL UCYSVALMET

670 680 690 700 710 720

ASNGLUMETG LYILEILETY RHISGLYALA TYRASNASPV ALALAGLUAR GSERTRPASN

730 740 750 760 770 780

TYRGLYGLNP HEASNTYRGL YVALLEUASP ALACYSLEUP HEILELEUAS PHISSERGLU

790 800 810 820 830 840

METPROILEI LEASNARGGL YASPPROVAL LYSVALTHRA RGGLNALASE RALAMETMET

850 860 870 880 890 900

ASNSERGLNA SPASPASNGL YVALLEUVAL GLYASPTRPS ERGLYASPTY RILETYRGLY

910 920 930 940 950 960

VALSERPROT HRSERTRPTH RGLYSERTHR ASPILELEUI LESERTYRAL AARGSERLYS

970 980 990 1000 1010 1020

ALAPROVALA RGTYRALAGL NCYSTRPVAL TYRALAGLYV ALPHEASNTH RPHELEUARG

1030 1040 1050 1060 1070 1080CYSLEUGLYI LEPROSERAR GVALVALTHR ASNPHEPHES ERALAHISAS PASNASPGLY

1090 1100 1110 1120 1130 1140

ASNLEULYST HRASPILEIL ELEUASPGLU ASNGLYLYSI LEASPLYSAS NARGTHRARG

1150 1160 1170 1180 1190 1200

ASPSERVALT RPASNTYRHI SCYSTRPASN GLUCYSTYRM ETSERARGPR OASPLEUPRO

1210 1220 1230 1240 1250 1260

GLNGLYTYRG LYGLYTRPGL NILEVALASP ALATHRPROG LNGLUTHRSE RASPGLYMET

1270 1280 1290 1300 1310 1320

TYRARGCYSG LYPROALASE RVALHISALA ILELYSHISG LYGLUILECY SPHEPROTYR

1330 1340 1350 1360 1370 1380

ASPALAALAP HEVALPHEAL AGLUVALASN SERASPVALV ALPHETYRSE RARGARGARG

1390 1400 1410 1420 1430 1440

ASPGLYTHRL EUASPLEUVA LLYSVALASN ARGTHRHISI LEGLYARGME TVALLEUTHR

1450 1460 1470 1480 1490 1500

LYSALAPROG LYGLUGLUTH RARGARGASP ILETHRSERG LNTYRLYSPH EPROGLUGLY

1510 1520 1530 1540 1550 1560

SERALAGLUG LUARGTHRVA LLEUGLULYS ALAGLUGLUT YRGLYCYSLY SARGVALLYS

1570 1580 1590 1600 1610 1620


34/48


35/48

490 500 510 520 530 540

ARGGLYSERA SPLYSHISPR OILEARGSER PROTRPLYSI LEGLYGLNLY SGLUTHRGLY

550 560 570 580 590 600

ILELEUASPI LECYSLEUAR GILELEUASP METASNPROL YSCYSLEUAR GASNPROGLY

610 620 630 640 650 660

LYSASPCYSS ERGLYARGAR GASNPROILE TYRVALSERA RGVALLEUSE RALAMETVAL

670 680 690 700 710 720

ASNCYSASNA SPASPLYSGL YVALVALLEU GLYASNTRPT HRGLYLYSTY RASPGLYGLY

730 740 750 760 770 780

VALSERPROM ETSERTRPAR GGLYSERVAL GLUILELEUA RGASNTRPAS PTHRGLNALA

790 800 810 820 830 840

CYSGLNPROV ALCYSTYRGL YGLNCYSTRP VALPHEALAA LAVALALACY STHRILESER

850 860 870 880 890 900ARGALALEUG LYILEPROCY SARGVALVAL THRASNTYRT RPSERALAHI SASPSERASN

910 920 930 940 950 960

SERASNLEUM ETILEGLUAR GTYRILEASP GLUASNGLYL YSLEULEULY SSERGLYGLU

970 980 990 1000 1010 1020

METILETRPA SNTYRHISCY STRPVALGLU SERTRPMETT HRARGPROAS PLEULYSSER

1030 1040 1050 1060 1070 1080

ASPPHEASNG LYTRPGLNAL ASERASPPRO THRPROGLNG LULYSSERGL YGLYVALTYR

1090 1100 1110 1120 1130 1140

CYSCYSGLYP ROVALPROLE UARGALAILE LYSGLUGLYG LULEUTHRPH ELYSTYRASP

1150 1160 1170 1180 1190 1200

ALAPROPHEI LEPHEALAGL UVALASNALA ASPVALILET HRPHEMETLY SARGLYSASP

1210 1220 1230 1240 1250 1260

GLYSERTHRS ERGLUVALTH RTHRSERTHR VALVALGLYG LNLYSILESE RTHRLYSSER

1270 1280 1290 1300 1310 1320

VALGLYSERA SPASPARGGL UASPILETHR HISLEUTYRL YSTYRSERGL UGLYSERALA

1330 1340 1350 1360 1370 1380

GLUGLUARGA LATHRPHEGL ULYSALAASN HISGLNASNL YSLEULEUHI SGLNGLNGLN

1390 1400 1410 1420 1430 1440

ASNGLNGLYL EUGLNLEUTH RILELYSPRO SERSERGLUM ETARGLYSGL YCYSASPPHE

1450 1460 1470 1480 1490 1500

ASPVALTYRA LAGLUVALIL EASNLYSTHR ASPSERVALL YSLYSCYSAR GLEUVALPHE

1510 1520 1530 1540 1550 1560

GLYSERCYSA LAALASERTY RASNGLYTHR LEUGLYGLUA SNCYSGLYPH ELYSASPLEU

1570 1580 1590 1600 1610 1620

LEUASNVALG LULEUSERPR OGLYALAGLY ARGLYSVALP ROLEULYSLE UASNTYRSER

1630 1640 1650 1660 1670 1680

LYSTYRSERS ERALALEUTH RGLUASPASN LEUILEARGL EUALAALALE ULEUVALASP


36/48

1690 1700 1710 1720 1730 1740

TYRSERTHRG LYGLUALATH RLEUALAVAL ARGASNILEV ALLEUASPAS NPROGLUILE

1750 1760 1770 1780 1790 1800

LYSVALARGI LELEUGLYGL UPROLYSGLU ASNARGLYSL EUALAALAGL UILETHRLEU

1810 1820 1830 1840 1850 1860

GLNASNPROL EUPROGLUPR OLEUGLUASN CYSCYSPHES ERILEGLUGL YALAASNLEU

1870 1880 1890 1900 1910 1920

THRGLYGLYA RGALAILESE RGLUARGLEU GLYSERALAV ALGLYPROGL YGLUGLUVAL

1930 1940 1950 1960 1970 1980

LYSALALYSI LETYRPHETH RPROASNHIS SERGLYLEUA RGLYSLEUVA LVALASNPHE

1990 2000 2010 2020 2030

ASPSERASNL YSLEUCYSHI SVALLYSGLY TYRARGASNV ALILEILEGL YLYSEND

4. Oreochromis ni loticus

10 20 30 40 50 60

METALAASNH ISLYSGLYLE UILESERASP VALASPLEUA RGSERARGGL UASNASNSER

70 80 90 100 110 120

ALAHISHIST HRARGGLUIL EASPGLNLYS ARGLEUILEV ALARGARGGL YGLNPROPHE

130 140 150 160 170 180

SERILETHRL EUGLNCYSAS NGLYSERLEU ARGPROARGH ISHISLEUAS PLEUVALLEU

190 200 210 220 230 240

HISLEUGLYL YSARGASPGL UVALGLUILE LYSVALGLNL YSGLUARGGL YALAGLYASP

250 260 270 280 290 300

LYSTRPTRPP HEASNGLNGL NGLYALAGLN ASPGLUMETL EULEUTHRLE UHISSERPRO

310 320 330 340 350 360

ALAASPALAI LEILEGLYAR GTYRSERLEU ALAVALLEUL EUMETSERPR OASPGLYARG

370 380 390 400 410 420

ILELEUGLUL YSLYSASPLY SMETSERPHE HISLEULEUT YRASNPROTR PCYSLYSASP

430 440 450 460 470 480

ASPVALVALT YRLEUPROAS PGLUTHRGLN LEUGLNGLUT YRILEMETAS NGLUASPGLY

490 500 510 520 530 540

ILEILETYRM ETGLYTHRTR PGLUTYRILE LYSSERTHRH ISTRPASNTY RGLYGLNPHE

550 560 570 580 590 600

GLUASPTYRV ALMETASPIL ECYSPHEGLU VALLEUASNA SNSERASNAS PALALEUARG

610 620 630 640 650 660

ASNSERGLNM ETASPILEGL UGLNARGPHE ASPPROVALT YRVALSERAR GILEILEALA

670 680 690 700 710 720

ALAMETVALA SNSERASNAS PASPARGGLY VALLEUTHRG LYARGTRPTH RGLUPROTYR


37/48


38/48

1930 1940 1950 1960 1970 1980

PROGLYGLNT HRVALSERIL EVALVALSER PHESERPROM ETARGTHRGL YVALARGLYS

1990 2000 2010 2020 2030 2040

LEULEUVALA SPPHEASPSE RASPARGLEU LYSASPVALL YSGLYVALTH RTHRVALVAL

2050 2060 2070 2080 2090

VALARGLYSL YSTYRARGAS NILEPHEPRO GLUILETHRG LUCYSTYREN D

6. Cyprinus carpio

10 20 30 40 50 60

METALALEUA SPILEGLYTH RTRPASPLEU ALACYSGLNP HEASNASNTH RASPHISHIS

70 80 90 100 110 120

THRGLULEUA SNGLYTHRAS PARGLEUILE VALARGARGG LYGLNALAPH ETHRILEASN

130 140 150 160 170 180

LEUTYRLEUA SNSERGLYSE RTYRGLNPRO GLYTYRSERG LNLEUHISIL ETHRALAGLU

190 200 210 220 230 240

THRGLYPROG LNPROGLUGL UGLNTYRGLY THRARGALAV ALLEUGLYLE USERASPGLU

250 260 270 280 290 300

ILEASPASPT HRARGTRPSE RALAGLYVAL SERSERPROS ERGLYASPTH RVALCYSLEU

310 320 330 340 350 360

SERVALCYSA LAALAPROAS PALAPROILE GLYARGTYRV ALLEUTHRLE UASPGLYHIS

370 380 390 400 410 420ILEGLNPHEA SPPHEILELE ULEUPHEASN PROTRPCYSP ROARGASPVA LVALTYRMET

430 440 450 460 470 480

ASPSERGLUG LULYSLEUAL AGLUTYRVAL LEUALAGLNA SPGLYILEIL EPHEARGGLY

490 500 510 520 530 540

ASPVALGLUT YRPROVALPR OLEUALATRP TYRPHEGLYG LNPHEGLUGL UGLYILELEU

550 560 570 580 590 600

ASPALACYSL EUARGILELE UASPMETASN PROLYSHISS ERARGASNPR OGLYLYSASP

610 620 630 640 650 660

CYSSERGLYA RGARGASNVA LILETYRVAL THRARGVALL EUSERALAME TILEASNSER

670 680 690 700 710 720

ASNASPARGA SPTYRGLYVA LLEUGLUGLY CYSTRPLYSA SPTHRPHEGL UGLYGLYVAL

730 740 750 760 770 780

SERPROMETS ERTRPARGGL YSERVALGLN ILELEUARGT HRTRPSERSE RTHRSERCYS

790 800 810 820 830 840

LEUPROVALA RGTYRGLYGL NCYSTRPVAL PHEALAALAV ALALACYSTH RVALSERARG

850 860 870 880 890 900

ALALEUGLYI LEPROCYSAR GVALVALTHR ASNPHETYRS ERALAHISAS PTHRASNSER

910 920 930 940 950 960


39/48

ASNLEUVALI LEGLUARGTY RLEUASNGLU LYSGLYGLUI LEASPSERSE RTHRARGASP

970 980 990 1000 1010 1020

METILETRPA SNTYRHISCY STRPVALGLU SERTRPMETT HRARGPROAS PPROPROPRO

1030 1040 1050 1060 1070 1080GLYPHEASPG LYTRPGLNAL ASERASPPRO THRPROGLNG LULYSSERGL UGLYVALPHE

1090 1100 1110 1120 1130 1140

CYSCYSGLYP ROVALPROLE UARGALAILE LYSGLUGLYG LULEUTHRPH ELYSTYRASP

1150 1160 1170 1180 1190 1200

ALAPROPHEV ALPHEALAGL UVALASNALA ASPLEUVALH ISILELEULY STYRASNASP

1210 1220 1230 1240 1250 1260

GLYSERTHRA RGLYSILEVA LASNGLUGLN LYSVALGLYG LNLYSILESE RTHRLYSSER

1270 1280 1290 1300 1310 1320

VALGLYARGA SPALAARGGL UASPILETHR HISLEUTYRL YSTYRPROGL UGLYSERVAL

1330 1340 1350 1360 1370 1380

GLUGLUARGG LNVALPHEGL ULYSALAASN HISGLNSERL YSLEUHISGL NGLNGLNALA

1390 1400 1410 1420 1430 1440

LYSPROGLYL EUGLNILETH RILELYSLEU SERTHRGLYI LEARGLYSGL YCYSASPPHE

1450 1460 1470 1480 1490 1500

ASPVALPHEA LAILEVALTH RASNASNTHR GLUGLUASPL YSLYSCYSAR GLEUVALPHE

1510 1520 1530 1540 1550 1560

ALASERARGA LAVALSERTY RASNGLYVAL ILEGLYARGG LUCYSGLYPH ELYSASPLEU

1570 1580 1590 1600 1610 1620

LEUASNLEUG LULEUALAPR OGLYGLYGLU ARGLYSVALP ROLEUARGLE UASNTYRSER

1630 1640 1650 1660 1670 1680

GLNTYRCYSA SNASNLEUTH RGLUASPASN LEUILEARGL EUGLYALALE ULEUILEASP

1690 1700 1710 1720 1730 1740

CYSSERTHRL YSGLUALAVA LMETALAMET ARGASPILEV ALLEUASPAS PPROGLUILE

1750 1760 1770 1780 1790 1800

LYSILEARGI LELEUGLYGL UPROLYSGLU LYSARGLYSL EUALAALAGL ULEUTHRLEU

1810 1820 1830 1840 1850 1860

GLNASNPROL EUPROGLUTH RLEUGLNGLY CYSCYSPHET HRILEGLUGL YALAASNLEU

1870 1880 1890 1900 1910 1920

THRGLYSERS ERILETHRGL ULYSLEUGLU SERPROILEG LUPROGLYGL NGLUALALYS

1930 1940 1950 1960 1970 1980

VALILEMETT YRPHETHRPR OTHRGLNSER GLYLEUCYSL YSLEUVALVA LASPPHEASP

1990 2000 2010 2020 2030

SERASPLYSL EUGLYHISVA LARGGLYTYR LYSASNVALI LEILEGLYLY SEND


40/48

Gambar Hydropathy plot dari berbagai biota perairan

Hydropathy plot transglutaminase ikan chum salmon (Oncorhynchus keta)

Hydropathy plot transglutaminase Salmo Salar


41/48

Hydropathy plot Oryzias latipes

Hydropathy plot Thunnus orientalis


42/48

Hydropathy plot Oreochrmis ni loticus

Hydropathy plot Cypr inus carpio

Hydropathy plot adalah analisis yang dilakukan untuk mengetahui sifat

hidrofobisitas dari protein. Asam amino yang bersifat hidrofobik ditunjukkan oleh

area positif dan terletak di bagian dalam protein, sedangkan asam amino yang

besifat hidrofilik ditunjukkan oleh area negatif dan terletak di bagian permukaan


43/48

protein. Puncak pada grafik hydropathy plot di atas menunjukkan hydropaty skor

dari asam amino penyusun enzim transglutaminase. Skor negatif menunjukkan

asam amino hidrofilik dan skor positif menunjukkan asam amino hidrofobik. Skor

asam amino ditunjukkan pada tabel di bawah ini.

Jenis Asam Amino Simbol Skor hidropati

Isoleusin I 4,5

Valin V 4,2

Leusin L 3,8

Fenilalanin F 2,8

Sistein C 2,5

Metionin M 1,9Alanin A 1,8

Glisin G -0,4

Treonin T -0,7

Triptofan W -0,9

Serin S -0,8

Tirosin Y -1,3

Prolin P -1,6

Histidin H -3,2

Asam glutamat E -3,5Glutamin Q -3,5

Asam Aspartat D -3,5

Asparagin N -3,5

Lisin K -3,9

Arginin R -4,5


44/48


45/48

Struktur protein enzim transglutaminase Thunnus ori entalis

Struktur protein enzim transglutaminase Oreochromis ni loticus

Struktur protein enzim transglutaminase Cypr inus carpio


46/48

Pohon filogenik berbagai biota perairan penghasil enzim transglustaminase.

Dari pohon filogenik di atas, terlihat hubungan kekerabatan berbagai biota

perairan penghasil enzim transglutaminase. Dari gambar di atas terlihat bahwa

ikan salmo salar memiliki kekerabatan yang paling dekat dengan ikan bluefin tuna

(Thunnus orientalis) dan ikan nila (Oreochromis niloticus) memiliki kekerabatan

yang paling dekat dengan ikan chum salmon (Oncorhynchus keta). Ikan mas

(Cyprinus carpio) memiliki hubungan kekerabatan yang lebih dekat dengan ikan

salmo salar dan bluefin tuna (Thunnus orientalis) dibandingkan dengan ikan nila

(Oreochromis niloticus) dan ikan chum salmon (Oncorynchus keta).

Struktur protein enzim transglutaminase dari ikan mas (Cyprinus carpio)

memiliki kemiripan dengan ikan salmo salar dan ikan bluefin tuna (Thunnus

orientalis). Begitu pula struktur protein transglutaminase dari ikan chum salmon

(Oncorhynchus keta) memiliki kemiripan dengan ikan nila (Oreochromis

niloticus). Hal ini semakin memperkuat alasan bahwa ikan mas (Cyprinus carpio),

ikan salmo salar dan ikan chum salmon (Oncorhynchus keta) memiliki

kekerabatan yang dekat. Selain itu, hasil alignment ketiga jenis ikan tersebut

menunjukkan kesamaan nukleotida yang cukup banyak. Hal ini ditunjukkan padagambar di bawah ini.


47/48

Hasil alignment ikan mas (Cypri nus carpio), ikan salmo salar dan ikan

bluefin tuna (Thunnus ori entalis)


48/48

PUSTAKA

Haard NF dan Simpson BK. 2000. Seafood Enzyme. Marcel Dekker, Inc. New

York. Hal 147-161.

http://web.expasy.org/

http://swissmodel.expasy.org/

Kyte, J. and Doolittle, R. 1982. A simple method for displaying the hydropathic

character of a protein.J. Mol. Biol. 157: 105-132.

Mohamad AB, Maskat MF, Ghani MA, Omar AF, Kashim MIA. 2012. The use of

transglutaminase enzymes in food: is there any issue of lawful and unlawful

in Islam.Research Journal of Applied Sciences 7(1):48-53

Renzetti S, Bello FD, Arendt EK. 2008. Microstructure, fundamental rheology

and baking characteristics of batters and breads from different gluten-free

flours treated with a microbial transglutaminase. Journal Cereal Sciences

48:33-45
http://web.expasy.org/http://web.expasy.org/http://swissmodel.expasy.org/http://swissmodel.expasy.org/http://swissmodel.expasy.org/http://web.expasy.org/

laporan enzim bu mala kel 1

Documents