ppt cara penamaan enzim kel 3

13

Upload: welly-andrei

Post on 16-Jul-2015

1.315 views

Category:

Education


6 download

TRANSCRIPT

Page 1: Ppt  cara penamaan enzim kel 3
Page 2: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

Biasanya diberi akhiran –ase pada nama substrat atau reaksi yang dikatalisis

Contoh:Alkohol dehidrogenase: oksidasi alkoholUrease: hidrolisis ureaDNA polimerase: polimerisasi nukleotidaProtease: hidrolisis peptidaMetiltransferase: transfer gugus metil

Page 3: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

Prinsip Penamaan

Enzim dikelompokkan dan diberi nama menurut reaksi yang dikatalisisnya.

Hanya merujuk pada perubahan reaksi kimia yang disebabkan oleh enzim.

Mekanisme reaksi tidak dimasukkan dan juga gugus prostetik atau kofaktor tidak masuk dalam nama.

Page 4: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

Enzim mempunyai nama sistematis dan nama trivial.Nama trivial: lebih pendek, mudah dan sering

digunakan

Page 5: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

Tata Nama• Menurut Enzyme Commission (1961), enzim dibagi

atas enam kelas tergantung pada reaksi yang dikatalisis.

• E.C.a.b.c.d– a. Kelas enzim– b. subkelas enzim– c. Sub-sub kelas enzim– d.Sub-sub-sub kelas enzim

• Pengelompokan tidak berdasarkan urutan asam amino, struktur tiga dimensi dan juga tidak berdasarkan mekanisme reaksi

Page 6: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

KELAS ENZIM BERDASARKAN REAKSI KIMIA Kelas Tipe katalisis reaksi kimia contoh

Oksidoreduktase ReduksiOksidasi, melepas/mendapat O2 dan Hidrogen

Cytochrome oksidase, laktate dehydrogenase

Transferase Transfer grup, seperti grup amino, grup acetyl, grup phosphat

Acetate kinase, alanin deaminase

Hydrolase Hidrolisis (penambahan air) Lipase, sukrase

Lyase pemindahan grup atom tanpa hidrolisis Oksalat decarboxylase, isocitrat lyase

Isomerase Penataan atom menjadi molekul Glikose-phosphate isomerase

ligase Menyatukan dua molekul (mengambil energi, dari turunan ATP)

DNA ligase

Page 7: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

b. Sub Kelas Enzim

• Digit kedua: Hidrogen atau donor elektron 1. Alkohol 2. Aldehid atau keton 3. CH-CH 4. Amin primer 5. Amin sekunder 6. NADH atau NADPHc. Sub-Sub Kelas enzim

• Digit ketiga: Hidrogen atau akseptor elektron 1. NAD+ atau NADP+

2. Fe 3+

3. O2

99. Akseptor lain

Page 8: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

OksidoreduktaseNama sistematik ditulis menurut: donor:akseptor oksidoreduktase

EC. 1.1.1 Nama Sistematik: Alkohol:NAD+ oksidoreduktaseNama Trivial: Alkohol dehidrogenase

(Nama trivial: Oksidase, transfer H ke O2; dan dehidrogenase, untuk transfer H ke akseptor selain O2)

Page 9: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

TransferaseMengkatalisis reaksi pemindahan berbagai gugus

fungsi seperti amino, karboksil, karbonil, metil, asil, glikosil, atau fosforil

A – X + B A + B – X Nama trivial yang umum seperti aminotransferase

(transaminase), transkarboksilase

Page 10: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

HidrolaseMengkatalisis pemutusan ikatan secara hidrolitik

pada C-C, C-N, C-O dan ikatan lainnya Nama-nama trivial seperti esterase, peptidase,

amilase, fosfatase, urease, pepsin, tripsin, kimotripsin

Page 11: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

Liase• Mengkatalisis pemutusan ikatan C-C, C-O, C-N, C-S. • Nama sistematik ditulis menurut substrat gugus liase.• Nama trivial, misalnya dekarboksilase, aldolase,

dehidratase (eliminasi CO2, aldehid, dan air).

Page 12: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

Isomerase

• Mengkatalisis penataan struktur atau geometri dalam molekul.

• Nama-nama trivial seperti epimerase, resemase, dan mutase

Page 13: Ppt  cara penamaan enzim kel 3

LigaseMengkatalisis pengikatan (penggabungan) dua molekul,

disertai dengan hidrolisis senyawa yang mempunyai ΔG besar untuk hidrolisis

Energi yang diperlukan untuk pembentukan ikatan tersebut sering berasal dari hidrolisis ATP

Nama trivial : tiokinase dan karboksilase