unit 3 bacteria dan archea

Upload: husna269

Post on 14-Apr-2018

288 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    1/21

    UNIT PELAJARAN 3

    BAKTERIA, ARKEA DAN VIRUS

    HASIL PEMBELAJARAN

    Pada akhir unit ini, anda diharap dapat:

    1. Menerangkan apakah itu sel prokariot.

    2. Membanding bezakan dua jenis dinding sel dalam bakteria.

    3. Menerangkan kepentingan organel-organel dalam bakteria dan arkea.

    4. Menghubung kaitkan kepelbagaian arkea dalam adaptasinya terhadap persekitaran

    lampau.

    5. Menerangkan struktur virus.

    6. Menerangkan mekanisme jangkitan virus.

    PENGENALAN

    Kebanyakan bakteria dan arkea adalah bersaiz lebih kecil berbanding organisma eukariot.

    Walaupun mereka ini merupakan struktur sel ringkas, kedua-duanya harus melakukan semua

    perkara yang dilakukan sel eukariot seperti mendapatkan tenaga daripada persekitaran dan

    menukarkan tenaga tersebut kepada bentuk yang boleh digunakan terutamanya dalam

    pergerakan dan biosintesis. Untuk mencapai tujuan ini, bakteria dan arkea akan berinteraksidengan persekitaran lalu bertindak balas terhadap rangsangan di sekeliling mereka. Tambahan

    pula, bakteria dan arkea mempunyai keupayaan metabolik yang mungkin berbeza daripada sel

    eukariot. Ciri-ciri biokimia yang unik ini adalah kritikal untuk kitaran nutrien di mana bakteria dan

    arkea memainkan sebahagian peranannya dalam mengekalkan keseimbangan ekosistem di

    bumi ini.

    Prokariot

    Sel daripada organism hidupan secara umumnya dibahagikan kepada sel eukariot dan sel

    prokariot. Anda telah pun mempelajari secara mendalam mengenai sel eukariot seperti sel

    haiwan dan sel tumbuhan dalam kursus Penghantar Biologi (TBR3013). Bakteria dan arkea

    pula merupakan kumpulan sel yang tergolong dalam prokariot (Rajah 3.1). Persoalannya,

    mengapakah terdapat pembahagian terhadap kumpulan-kumpulan sel ini? Dalam bab ini, anda

    akan mula menyingkap kepada kewujudan struktur-struktur pada bacteria dan arkea

    sehinggakan kedua-dua jenis sel ini tergolong dalam kumpulan yang berbeza daripada eukariot

    dan dinamakan prokariot.

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    2/21

    Rajah 3.1: Morfologi sel bakteria

    Walaupun istilah prokariot mula diperkenalkan pada awal abad ke-20, konsep ini tidak diguna

    pakai sepenuhnya sehingga pada tahun 1962, apabila R. Stanier dan vanNiel CB menyifatkan

    prokariot dari segi kekurangan mereka berbanding sel-sel eukariot. Sebagai contoh, Stanier dan

    vanNiel telah menegaskan bahawa sel prokariot tidak mempunyai membran yang mengelilingi

    bahan genetiknya, tiada sitorangka, organel yang tidak diselaputi membran dan ketiadaan

    struktur membran dalaman seperti retikulum endoplasma dan Jasad Golgi.

    Berdasarkan kepada pembacaan dan pemahaman anda mengenai sel prokariot dan

    sel eukariot, cuba bezakan ciri-ciri antara kedua-dua sel ini.

    Ciri Sel prokariot Sel eukariot

    Saiz

    Nukleus

    Organel

    Organisasi

    A

    Nukleolus

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    3/21

    Morfologi Bakteria dan Arkea

    Untuk mengkaji sel prokariot ini dengan lebih lanjut, kita harus meneliti terlebih dahulu bentuk

    dan susun atur bakteria dan arkea dalam persekitaran (Jadual 3.1). Kita mungkin akan

    menjangka bahawa organisma yang kecil dan ringkas seperti bakteria dan arkea ini jugamempunyai bentuk dan saiz yang seragam. Jangkaan ini adalah salah sama sekali! Ini kerana

    kedua-dua sel ini menawarkan kepelbagaian morfologi sungguhpun sel itu sendiri adalah

    ringkas. Akan tetapi, bentuk yang paling lazim dijumpai dalam kedua-dua domain ini adalah

    kokus (sfera) dan rod (basilus).

    Jadual 3.1: Bentuk dan susun atur lazim sel bacteria.

    Morfologi Susun Atur Contoh

    Kokus (sfera)

    Kokus dalam rantaian

    Kokus dalam gugusan

    Streptococcus agalactiae

    Staphylococcus aureus

    Rod (basilus)

    Rod dalam rantaian

    Bacillus megaterium

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    4/21

    Vibrio

    Bentuk koma

    Vibrio cholerae

    Spirilum Bentuk spiral

    Bentuk spirokit

    R. rubrum

    Leptospira interrogans

    Filamen

    Membentuk filament yang dinamakan

    hifa

    Streptomyces sp.

    Pleomorfik

    (bentuk tidak tetap)

    Bentuk segi empat

    Haloquadratum walsbyi

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    5/21

    Bentuk dahan

    Thermoproteus tenax

    Apabila sel bakteria daripada genus dan spesies yang sama hidup bersama,

    mereka sering membentuk susunan sesama sendiri (sama ada secara gugusan

    atau pun rantaian). Apakah kepentingannya hasil daripada susunan ini?

    Organisasi Sel

    Sel-sel bakteria dan archaeal dikelilingi oleh beberapa lapisan, yang secara kolektifnya dikenali

    sebagai sampul. Lapisan di bahagian paling dalam sampul sel adalah membran plasma, yang

    mengelilingi sitoplasma dan serta kandungannya. Kebanyakan bakteria dan arkea mempunyai

    dinding sel yang kompleks, iaitu lapisan yang menyelaputi membran plasma. Bakteria juga

    lazimnya dikelilingi kapsul atau lapisan lendir luar dinding sel. Walau bagaimanapun, kehadiran

    kapsul ini tidak meluas di kalangan arkea.

    Seperti yang telah dinyatakan sebelum ini memandangkan kebanyakan bakteria dan arkea

    tidak memiliki membran dalaman dan membran organel, maka morfologi dalamannya kelihatan

    seperti sangat ringkas berbanding sel eukariot. Bahan-bahan genetiknya yang dikenali sebagai

    nukleiod pula dikumpulkan pada satu kawasan setempat dan tidak dikelilingi membran.

    Manakala, ribosom dan lompang bertaburan di sekitar sitoplasmanya. Untuk pergerakan,

    bakteria dan arkea biasanya menggunakan flagela. Jadual 3.2 menunjukkan struktur-struktur

    yang biasa dijumpai dalam bakteria dan arkea beserta fungsinya.

    Jadual 3.2: Struktur dan fungsi organel dalam bakteria dan arkea.

    Organel Struktur dan Fungsi

    Membran plasma

    Membran separa telap; Terdiri daripada dua lapisan fosfolipid;

    Mengawal atur kemasukan nutrien dan pembuangan sisa sel;

    Mempunyai enzim untuk proses respirasi dan sintesis dinding sel

    bakteria.

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    6/21

    Lompang gasTerdiri daripada vesikel gas; Tujuan sebagai pengapungan sel dalam

    persekitaran akuatik.

    Lompang sel Granul penyimpanan makanan.

    Ribosom Tapak sintesis protein.

    Nukleolus Kawasan pengumpulan bahan genetik iaitu DNA.

    Plasmid Molekul DNA (heliks ganda dua) bersaiz kecil yang wujud secaraberasingan daripada kromosom DNA.

    Dinding sel

    Dalam bakteria, terbahagi kepada dua jenis iaitu gram negatif dan

    gran positif; memberikan bentuk kepada sel dan mengawal

    perubahan tekanan osmosis.

    Kapsul dan lapisan

    lendir

    Lapisan paling luar sel; Bertindak melindungi sel daripada fagositosis

    dan tapak penjerapan sel kepada permukaan; jarang dijumpai dalam

    arkea.

    Flagela dan pili Pergerakan sel

    Endospora

    Struktur jasad rehat sel; Bertindak sebagai struktur dorman semasa

    kekurangan nutrien dan kekeringan; Endospora akan bercambahmembentuk sel hidup yang aktif apabila keadaan sekeliling sesuai

    untuk pertumbuhan; Biasa dijumpai dalam bakteria sahaja.

    Memandangkan terdapat pertindihan struktur dan fungsi organel dalam sel prokariot dan sel

    eukariot, maka cuma organel-organel yang berbeza dari segi struktur dan fungsinya dalam

    prokariot dan tidak dijumpai dalam eukariot yang akan dibincangkan dengan lebih lanjut.

    Contohnya adalah seperti dinding sel bakteria dan arkea, kapsul dan endospora.

    Dinding Sel Bakteria

    Bakteria boleh dibahagikan kepada dua kumpulan utama berdasarkan tindak balas pewarnaan

    Gram. Bakteria dalam kumpulan gram-positif berwarna ungu, manakala bakteria gram-negatif

    adalah berwarna merah atau merah jambu. Dinding sel gram-positif terdiri daripada satu lapisan

    tebal homogen peptidoglikan (murein), berukuran 20-80 nm tebal, yang menyelaputi membran

    plasma (Rajah 3.2). Sebaliknya, dinding sel negatif gram adalah agak kompleks. Ia mempunyai

    lapisan peptidoglikan tebal (2-7 nm) serta membran luar (berukuran 7-8 nm tebal) yang

    mengelilinginya (Rajah 3.2). Dinding sel gram-positif adalah lebih tahan kepada tekanan

    osmosis kerana lapisan peptidoglikan yang lebih tebal berbanding bakteria gram-negatif. Satu

    ciri penting yang terdapat pada dinding sel bakteria gram-negatif adalah satu ruang yang sering

    kelihatan antara membran plasma dan membran luar. Ruang ini dikenali sebagai ruang

    periplasma. Ia mengandungi enzim hidrolitik dan protein pengikat yang bertujuan dalampemprosesan dan penyerapan nutrien.

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    7/21

    Rajah 3.2: Perbezaan antara dinding sel Gram-positif dan Gram-negatif.

    Dinding sel arkea

    Sebelum arkea digolongkan sebagai satu domain kehidupan yang unik, ia dicirikan sebagai

    sama ada bersifat gram-positif atau gram-negatif. Walau bagaimanapun, keputusan daripada

    teknik pewarnaan Gram tidak menunjukkan kesimpulan yang nyata bahawa dinding sel arkea

    menyamai mana-mana struktur dinding sel sama ada gram-positif mahupun gram-negatif. Ini

    juga membuktikan bahawa struktur dinding sel arkea berbeza daripada bakteria dari segi

    kimianya di mana dinding sel arkea kekurangan peptidoglikan dan mempamerkan kepelbagaian

    dalam struktur kimia. Contoh struktur kimia yang selalu dijumpai pada dinding sel arkea adalahseperti lapisan S, sarung protein, methanokondroitin, pseudomurein dan polisakarida (Rajah

    3.3).

    Gram-positif Gram-negatif

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    8/21

    Rajah 3.3: Kepelbagaian struktur kimia pada dinding sel arkea.

    Kapsul

    Kebanyakan bakteria mempunyai satu lagi lapisan tambahan di luar dinding sel iaitu kapsul

    (Rajah 3.4). Kapsul adalah lapisan teratur yang menjerap kuat pada dinding selnya. Ia biasanyaterdiri daripada polisakarida, tetapi ada juga yang dibina daripada bahan-bahan lain. Struktur ini

    boleh dilihat dengan jelas dalam mikroskop cahaya apabila teknik pewarnaan negatif ataupun

    prosedur pewarnaan kapsul yang khas digunakan pada bakteria. Walaupun kapsul tidak

    diperlukan untuk pertumbuhan dan pembiakan, ia membantu bakteria patogenik dalam

    menentang phagositosis oleh sel perumah. Kandungan air yang tinggi dalam kapsul membantu

    melindungi sel bakteria daripada kekeringan. Struktur ini juga melindungi sel daripada serangan

    bakteriofaj dan bahan-bahan kimia hidrofobik yang lain seperti detergen.

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    9/21

    Rajah 3.4: Kehadiran kapsul pada Klebsiella pneumonia yang dilihat di bawah mikroskop

    cahaya selepas teknik perwarnaan kapsul.

    Endospora

    Beberapa genus bakteria gram-positif, termasuk Bacillus dan Clostridium serta Sporosarcina

    boleh membentuk struktur dorman yang dipanggil endospora (Rajah 3.5). Pembentukan

    endospora biasanya bermula apabila pertumbuhan terhenti disebabkan oleh kekurangan

    nutrien. Oleh itu, ia adalah satu mekanisme kemandirian yang membolehkan bakteria

    menghasilkan sel dorman yang boleh bertahan sehingga nutrien boleh didapati kembali dan

    pertumbuhan vegetatif dapat diteruskan.

    Rajah 3.5: Endospora dalam sel bacteria.

    Endospora mempunyai ketahanan luar biasa terhadap sebarang perubahan alam sekitar seperti

    haba, sinaran ultraungu, sinaran gamma dan kekeringan. Malah, sesetengah endospora

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    10/21

    mampu selama 100,000 tahun! Endospora juga boleh hidup dalam air yang mendidih selama

    lebih daripada satu jam. Kehadiran pelbagai lapisan dalam endospora dianggap telah

    menyumbang kepada kerintangannya terhadap haba dan agen-agen pembunuh yang lain

    (Rajah 3.6). Lapisan eksosporium dan spora kot mampu melindungi spora tersebut daripada

    bahan kimia. Spora kot ini juga adalah tidak telap terhadap molekul-molekul toksik. Sifat ini juga

    dikongsi oleh membran dalam, iaitu lapisan yang memisahkan antara korteks dan teras spora.

    Rajah 3.6: Keratan rentas endospora daripada Bacillus subtilis yang menunjukkan kehadiran

    banyak lapisan pada strukturnya.

    Endospora dikenali sebagai organel yang mempunyai kerintangan luar biasa

    terhadap perubahan di sekelilingnya. Apakah perubahan sekeliling yang

    dimaksudkan? Apakah pula ciri-ciri yang dimilikinya untuk mempunyai

    kerintangan sedemikian?

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    11/21

    Adaptasi arkea terhadap persekitaran melampau

    Arkea mendiami pelbagai habitat dan selama ini ianya telah dianggap sebagai mikrob yang

    hidup di persekitaran lampau atau dikenali juga sebagai extremophiles (Rajah 3.7).

    Persekitaran lampau ini sering mencerminkan suatu situasi di mana manusia tidak boleh hidup.

    Antara contoh-contoh lampau atau extreme yang didiami arkea ini adalah seperti suhu atau pHyang sangat tinggi atau rendah (glasier dan kolam air panas), kepekatan garam yang tinggi

    (lautan), ketiadaan oksigen dan di bawah tekanan yang amat tinggi (dasar laut).

    Rajah 3.7: Persekitaran lampau seperti kolam air panas, glasier dan dasar laut sering menjadi

    habitat arkea.

    Keupayaan arkea untuk hidup di habitat-habitat seumpama ini menunjukkan bahawa

    mikroorganisma ini memiliki kepelbagaian dari segi morfologinya seperti bentuk sfera, rod,

    spiral, kuboid, segi tiga, plat atau pleomorfik. Begitu juga kepelbagaian dari segi fisiologinya

    yang berupaya untuk menjalani proses sama ada aerobik, anaerobik fakultatif, anaerobik tegar,

    chemolitoautotrof ataupun organotrof. Ciri-ciri beberapa kumpulan arkea juga dirumuskan padaJadual 3.3.

    Jadual 3.3: Ciri-ciri beberapa kumpulan arkea.

    Kumpulan Ciri-ciri Contoh

    Arkea metanogenAnaerob tegar; Hasil akhir metabolik adalah

    metana.

    Methanobacterium

    Methanococcus

    Methanomicrobium

    Methanosarcina

    Arkea penurun sulfat Berbentuk kokus; Menghasilkan hidrogensulfida daripada thiosulfat dan sulfat; Anaerob

    tegar; Hidup di kawasan thermofil lampau.

    Archaeoglobus

    Arkea halofil lampau

    Berbentuk rod, kokus, pleomorfik, piramid atau

    kuboid; Memerlukan persekitaran bergaram

    pada kepekatan melebihi 1.5 M untuk hidup;

    Boleh menggunakan tenaga cahaya untuk

    menghasilkan ATP.

    Halobacterium

    Halococcus

    Natronobacterium

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    12/21

    Arkea tanpa dinding

    sel

    Berbentuk pleomorfik; Fakultatif anaerob;

    Termoasidofil dan kimoorganotrofil.Thermoplasma

    VIRUS

    PENGENALAN

    Dunia mikrobiologi bukan sahaja terdiri daripada organism sellular, bahkan juga agen-agen

    berjangkit bukan sel. Di dalam topik ini, kita akan mengalihkan perhatian pula kepada agen-

    agen berjangkit seperti virus (virion), viriod dan prion. Ia merupakan mikroorganisma yang

    paling halus dengan anggaran diameter antara 10 hingga 400 nm. Oleh itu, pengamatan

    kebanyakan virus hanya dapat dilakukan melalui mikroskop elektron. Seperti yang dinyatakan

    sebelum ini, agen-agen ini dikelaskan sebagai bukan sel memandangkan sifatnya yang

    menggunakan sistem sintesis protein dan sistem penjanaan tenaga daripada sel perumah untukmemastikan kemandiriannya. Virus boleh menjangkiti suatu julat perumah luas yang

    merangkumi manusia, haiwan, tumbuhan, bakteria, protozoa dan kulat. Virus juga boleh

    diklasifikasikan kepada pelbagai famili berdasarkan kepada struktur bahan genetic (genom),

    kitaran hidup, morfologi (Rajah 3.8) dan perkaitan genetik sesuatu virus.

    Rajah 3.8: Morfologi pelbagai jenis virus

    Antara hidup dan bukan hidup

    Selepas mempelajari topik bakteria dan arkea, bolehkah anda memberikan ciri-ciri penting yang

    harus dipunyai kedua-dua mikroorganisma ini? Apakah struktur-struktur yang hadir yang boleh

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    13/21

    membezakannya? Persoalan ini amat penting kerana anda bakal mempelajari satu struktur

    organik yang lain yang jauh berbeza daripada bakteria mahupun arkea. Struktur organik yang

    dimaksudkan adalah virus.

    Sepertimana yang anda sedia maklum, bakteria dan arkea merupakan benda hidup. Namun,

    berbeza pula dengan virus kerana masih banyak lagi perdebatan antara saintis-saintis yangmempersoalkan kewujudan virus sebagai benda hidup ataupun bukan hidup berdasarkan ciri-

    ciri istimewa yang dimiliki virus. Memandangkan tiada lagi fakta kukuh yang mempertahankan

    kedudukan virus dalam sebarang klasifikasi ini, kita cuma menamakan virus ini sebagai suatu

    struktur organik.

    Dalam mikrobiologi, virus dan bakteria dibezakan berdasarkan saiz, kaedah pembiakan dan

    rintangan kepada pelbagai jenis campur tangan perubatan. Virus merupakan parasit. Jadi, virus

    memerlukan tuan rumah hidup untuk membiak. Virus menikmati jangka hayat jenis tidak aktif

    dan boleh hidup untuk beribu tahun sebelum mendapat tuan rumah yang sesuai untuk

    membiak. Virus akan memanipulasi metabolisme sel perumahnya supaya kod genetik virus

    tersebut boleh direplikasikan dan seterusnya melipat gandakan strukturnya dalam sel perumah

    tersebut. Jadual 3.4 memperincikan ciri-ciri yang dimiliki virus yang membezakannya dengan

    bakteria.

    Jadual 3.4: Perbezaan antara virus dan bakteria.

    Ciri-ciri Bakteria Virus

    Saiz 800-4000 nm 10-400 nm

    Ribosom Hadir Tidak hadir

    Enzim HadirHanya hadir pada sesetengah

    virus

    Struktur genetikKedua-dua DNA dan RNA

    berada dalam sitoplasma

    Cuma DNA atau RNA sahaja

    dan dikelilingi sarung protein.

    Pembiakan Belahan dedua; Konjugasi

    Menjangkiti sel perumah dan

    memanipulasi metabolism

    perumah supaya DNA atau

    RNA dan struktur virus dilipat

    gandakan. Sel perumah akan

    mati apabila struktur virus

    yang sempurna dilepaskan.

    Kepentingan

    Sesetengahnya adalahpatogenik. Ada yang berguna

    dalam kesihatan (contohnya

    bakteria dalam sistem

    penghadaman). Ada yang

    berguna dalam persekitaran

    (contohnya bioremediasi)

    Kebanyakan adalah

    patogenik. Sesetengah

    berguna untuk kejuruteraan

    genetik.

    Jangkitan Setempat Sistemik

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    14/21

    Cara mengubati jangkitan Antibiotik Vaksin

    Struktur Am Virus

    Zarah virus yang sempurna ataupun virion mempunyai tiga komponen biomolekul utama iaitu

    asid nukleik [hanya boleh terdiri daripada asid deoksiribonukleik (DNA) atau asid ribonukleik(RNA) sahaja], protein dan lipoprotein (Rajah 3.9). Genom virus boleh terdiri daripada

    bebenang tunggal ataupun bebenang ganda dua. Namun, genom virus tidak semestinya wujud

    dalam bentuk linear kerana terdapat juga virus yang mengangungi genom bersegmen seperti

    virus influenza dan virus kumpulan retro (Darah dan Ibrahim, 2004).

    Rajah 3.9: Struktur am virus.

    Sesetengah virus mempunyai suatu struktur luaran yang terdiri daripada protein iaitu kapsid

    yang menyelaputi genomnya (Darah dan Ibrahim, 2004). Ia terbentuk daripada bilangan tertentu

    molekul subunit protein kapsomer yang tersusun secara khusus untuk menghasilkan bentuk

    yang mencirikan sesuatu zarah virus. Kompleks asid nukleik-kapsid ini juga dikenali sebagai

    nukleokapsid.

    Selain daripada struktur-struktur yang dibincangkan tadi, sesetengah virus mempunyai struktur

    tambahan di luar nukleokapsid yang dinamakan sebagai sampul. Kadang kala, unjuran pendek

    iaitu spike juga boleh ditemui pada permukaan sampul virus. Kehadiran spike adalah amat

    penting semasa proses jangkitan virus di mana struktur ini berperanan sebagai tapak

    perlekatan kepada sel perumah dan juga dijadikan sebagai satu ciri pengenalan virus.

    Bentuk virus

    Berdasarkan kepada penyusunan dan binaan kapsomer pada kapsid, virus boleh dibahagikan

    kepada beberapa bentuk tertentu seperti di Jadual 3.5.

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    15/21

    Jadual 3.5: Pengelasan virus berdasarkan kepada beberapa bentuk tertentu.

    Bentuk Struktur umum Ciri-ciri

    Ikosahedron

    Struktur virus yang biasa dijumpai.

    Terdiri daripada 20 permukaan

    segi tiga sama dan 12 penjuru. Struktur yang paling efisien untuk

    menyelaputi ruang.

    Contoh: Polyomavirus,

    Adenovirus, Human papilomavirus

    dan Picornavirus

    Heliks

    Menyerupai rod panjang

    berongga.

    Kapsomer disusun bersama

    seperti bentuk pita/tali telefon

    (heliks). Semakin panjang saiz rod,

    semakin besar saiz asid nukleik.

    Contoh: Tobacco mosaic virus

    (TMV).

    Simetri

    kompleks

    Struktur yang mengelirukan.

    Terdapat juga bentuk yang tidak

    tetap yang dikenali sebagai virus

    pleomorfik.

    Mempunyai bahagian yang

    berbeza dari segi rupa dan simetri.

    Contoh: Bakteriofaj.

    Struktur bakteriofaj:

    Dibahagikan kepada kepala, leher

    dan ekor.

    Kapsid berbentuk heliks atau

    simetri.

    Terdiri daripada pelbagai morfologi

    seperti kubus, filament, berekor

    dan pleomorfik.

    Penggandaan Virus

    Perbezaan dari segi struktur dan genom virus mempunyai implikasi penting yang akan

    menentukan jenis mekanisme yang digunakan virus untuk menggandakan dirinya dalam sel

    perumah. Walaupun terdapat virus yang mempunyai struktur genom yang sama, tetapi masing-

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    16/21

    masing boleh mempamerkan kitaran hidup yang unik. Namun begitu, corak umum kitaran hidup

    virus boleh dikaji (Rajah 3.10). Sepertimana yang anda ketahui, virus merupkan parasit. Oleh

    itu, virus memerlukan sel perumah di mana ianya boleh membiak dan langkah pertama dalam

    kitaran hidup virus adalah penjerapan kepada perumah. Ini diikuti oleh kemasukan sama ada

    nucleokapsid atau asid nukleik virus (penembusan) ke dalam perumahnya. Jika nucleokapsid

    memasuki perumahnya, pelepasan genom ke sitoplasma biasanya berlaku sebelum kitaranhidup memasuki peringkat seterusnya. Sebaik sahaja di dalam sel perumah, peringkat sintesis

    akan bermula. Pada peringkat ini, maklumat yang dikodkan oleh genom virus akan

    diterjemahkan di mana gen virus akan menjalani transkripsi dan translasi. Ini seterusnya

    membolehkan virus mengambil alih kawalan sel perumah lalu menggunakan sistem

    metabolismenya untuk menghasilkan genom virus dan protein. Ini diikuti oleh peringkat

    pemasangan struktur virus di mana nucleokapsid baru akan dibina daripada pengabungan

    sarung protein dengan asid nukleik virus tersebut. Akhirnya, semasa langkah pembebasan,

    dinding sel perumah akan pecah melalui proses lisis lalu membebaskan partikel virus matang

    yang baru. Pembebasan virus ini biasanya mengakibatkan kematian sel perumah.

    Rajah 3.10: Kitaran penggandaan virus

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    17/21

    Jangkitan Virus: Bakteriofaj

    Berbalik kepada kitaran penggandaan virus di mana virus akan mereplikasikan dirinya sejurus

    selepas memasuki sel perumah dan diikuti dengan pembebasan virus daripada sel perumah

    melalui proses lisis (Rajah 3.10). Kitaran ini juga menggambarkan kitaran hidup faj (virus yang

    hanya menjangkiti bakteria) virulen. Contoh terbaik faj virulen adalah bakteriofaj T4.

    Selain itu, terdapat juga sejenis faj yang dinamakan faj temperat iaitu faj yang kurang virulen

    dan mempunyai dua kitaran hidup yang berbeza (Rajah 3.11). Contoh faj temperat adalah

    bakteriofaj lambda. Pertama, sebaik sahaja memasuki sel perumah, faj ini akan mereplikasi dan

    memusnahkan perumahnya seperti faj virulen. Atau keduanya, faj ini boleh kekal dalam sel

    perumahnya tanpa memusnahkannya. Bagaimana ini boleh berlaku? Kebanyakan contoh boleh

    dilihat apabila genom faj tersebut diintegrasikan ke dalam kromosom sel perumahnya.

    Rajah 3.11: Kitaran litik dan lisogenik faj temperat.

    Hubungan antara faj temperat dan sel perumahnya dikenali sebagai lisogeni. Manakala bentuk

    virus yang kekal dalam perumahnya itu dipanggil profaj dan bakteria yang dijangkitinya

    dipanggil lisogen atau bakteria lisogenik. Bakteria lisogenik mempunyai dua ciri yang amat unik

    iaitu; (1) bakteria yang pernah dijangkiti tidak akan mengalami jangkitan kali kedua oleh faj yang

    sama, dan (2) bakteria lisogenik ini boleh berubah dari kitaran lisogenik ke kitaran litik.

    Perubahan kitaran ini biasanya berlaku apabila terdapat perubahan persekitaran atau radiasi

    ultraungu terhadap sel perumah tersebut.

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    18/21

    Anda telah pun mempelajari fungsi spike pada capsid virus dan kitaran jangkitan

    virus pada sel perumahnya. Sekarang, cuba anda kaitkan kehadiran spike ini

    dalam kitaran jangkitan virus.

    RINGKASAN

    1. Sel prokariot merupakan sekumpulan sel unisellular yang tidak mempunyai membran

    nukleus dan membran dalam organel-organelnya.

    2. Dinding sel bakteria terdiri daripada dua jenis iaitu Gram-positif dan Gram-negatif.

    Ketebalan peptidoglikan pada Gram-positif adalah lebih tebal berbanding Gram-negatif.

    3. Kewujudan organel-organel dalam bakteria dan arkea biasanya dikaitkan dengan

    tujuannya untuk terus bermandiri pada persekitaran yang sering berubah.

    4. Arkea memiliki kepelbagaian morfologi dan sistem biologi dalam adaptasinya terhadap

    persekitaran lampau.

    5. Virus merupakan suatu entiti organik yang mempunyai struktur am seperti genom (DNA

    atau RNA sahaja) dan kapsid. Struktur sampul dan spike pula mungkin hadir pada

    sesetengah virus.

    6. Virus menjangkiti sel perumahnya melalui dua mekanisme iaitu kitaran lisis dan kitaran

    lisogeni.

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    19/21

    PETA KONSEP

    Aselular

    Sel prokariot

    Selular

    Bentuk

    DNA/RNA Sampul

    Heliks Simetri

    kompleks

    Struktur

    Kapsid

    Ikosahedron

    Spikes

    Jangkitan

    kepada

    perumah

    Kitar

    lisis

    Ki

    liso

    Arkea

    Habitat

    Persekitaran

    lampau

    Dinding

    sel

    Lapisan

    S

    Sarung

    protein

    Methanokondrointin Pseudomurein

    Contoh

    Methanogen

    Halofil lampau

    Bakteria

    Bentuk

    okus

    Rod

    Vibrio

    Spirilum

    Filamen

    Pleomorfik

    Organel

    Dinding

    sel

    Gram

    ositif

    Gram

    negatif

    Membran

    lasma

    Lompang

    Ribosom

    Nukleolus

    Plasmid

    Ka sul

    Fla ella Endos ora

    Pili

    SelGas

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    20/21

    KATA KUNCI

    1. Prokariot 2. Bakteria

    3. Arkea 4. Gram-positif

    5. Gram-negatif 6. Nukleolus

    7. Persekitaran lampau 8. Virus

    9. Kitar lisis 10. Kitar lisogeni

    PENILAIAN KENDIRI

    1. Apakah itu sel prokariot?

    2. Senaraikan organel-organel umum sel prokariot.

    3. Bagaimanakah kita membezakan sel-sel bakteria Gram-positif dan Gram-negatif di

    bawah mikroskop?

    4. Nyatakan perbezaan antara flagela dan pili yang terdapat pada sel bakteria.

    5. Mengapakah plasmid perlu wujud dalam sel bakteria?

    6. Terangkan mekanisme adaptasi arkea terhadap persekitaran lampau seperti suhu tinggi,

    tekanan tinggi dan anaerob.

    7. Mengapakah virus tidak dikategorikan sebagai organisma hidup?

    8. Nyatakan struktur-struktur am pada virus.

    9. Terangkan proses penggandaan virus dalam sel perumah.

    10. Terangkan mekanisme jangkitan bakteriofaj pada sel bakteria.

    BIBLIOGRAFI

    Willey, J. M., Sherwood, L. M. dan Woolverton, C. J. 2011. Prescotts Microbiology. McGraw-

    Hill, New York.

    Ibrahim, D. dan Omar, I. C. 2004. Konsep Dalam Mikrobiologi: Biologi Mikroorganisma. Penerbit

    USM, Malaysia.

  • 7/30/2019 Unit 3 Bacteria Dan Archea

    21/21

    JAWAPAN SERTA MAKLUMBALAS

    Ciri-ciri Sel prokariot Sel eukariot

    Saiz Lebih kecil Lebih besar

    Nukleus Tidak dikelilingi membran Dikelilingi membran

    Organel

    Tidak dikelilingi membran.

    Mempunyai organel tambahan

    seperti kapsul dan endospora.

    Dikelilingi membran dalam.

    Organisasi Ringkas Kompleks

    A