makalah sistematika mikrobia

Upload: setyandot

Post on 07-Jul-2018

254 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    1/17

    PRAKATA

     Alhamdulillahirabbil’aalamin,  puja dan puji syukur kami persembahkan

    kepada Allah SWT yang telah melimpahkan rahmatNya sehingga kami bisa

    menyelesaikan makalah yang berjudul “Filogeni Mikrobia Prokariotik !akteria"

    dengan baik# Makalah ini disusun demi memenuhi tugas Sistematika Mikrobia#

    Adapun terbentuknya makalah ini telah kami usahakan semaksimal mungkin$

    tetapi tidak terlepas oleh bantuan dari berbagai pihak yang telah memperlan%ar dalam

     pembuatan makalah ini# &leh karena itu$ kami mengu%apkan banyak terimakasih

    kepada 'r# (ndah Retnaningrum#$ M# (ng selaku dosen pengampu matakuliah

    Sistematika Mikrobia dan teman)teman yang sudah berkontribusi dalam pembuatan

    makalah ini#

    Kami masih sangat menyadari bah*a makalah ini jauh dari sempurna# +ntuk 

    itu dengan tangan terbuka$ kami mengarapkan kepada pemba%a untuk memberi kritik 

    dan saran yang membangun demi perbaikan makalah ini#

    Semoga makalah ini memberikan in,ormasi bagi masyarakat dan berman,aat

    untuk pengembangan *a*asan dan peningkatan ilmu pengetahuan bagi kita semua#

    -ogyakarta$ No.ember /012

    Penulis

    1

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    2/17

    Daftar Isi

    Cover .......................................................................................................................... i

    Prakata 3333333333333333333333333333######## ii

    'a,tar 4si 33333333333333333333333333333 iii

    !ab 1# Pengantar 333333################################################################################## 1

    1#1 5atar !elakang 3333###333333333333#33333### 1

    1#/ Rumusan Masalah ##############33333333333333333### /

    1#6 Tujuan 3333333##333333333333333#333 /

    !ab /# 4si33#############################################333333333333333##### 6

    /#1 Karakter +tama 'omain !akkteria333333333###3##333## 6

    /#/ Klsi,ikasi 'omain !akteria######################################################################## 7/#6 Analisis Filogenetik Rhi8obia yang 'iisolasi dari Aeschynomene spp# ####2

    !ab 6# Penutup#############################################################################################################16

    'a,tar Pustaka##############################################################################################################17

    2

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    3/17

    BAB I

    PENDAHULUAN

    1.1. Latar BelakangMikrobia di alam jumlahnya relatif banyak dan beranekaragam.

    Pada tahun 1978 eorang ahli mikrobia bernama Carl. !oee

    berhail meneliti molekul "#$ "iboomal yang menjadi daar

    %engelom%okan item & domain. 'item terebut terdiri dari

    domain arkaea( bakteria( dan eukarya. )eberhailan terebut

    membuat kemajuan yang %eat dalam bidang itematika. *alam

    mem%elajari keanekaragaman dan hubungan kekerabatan makhluk

    hidu% di bumi dibuatlah item klai+kai. ,erda%at item

    klai+kai fenetik dan +logenetik. 'item klai+kai fenetik

    didaarkan %ada kemiri%an ifat ementara item klai+kai

    +logenetik didaarkan %ada hubungan evoluioner. )eduanya

    memiliki keunggulan dan kelemahan.*ari ketiga domain terebut terda%at 2 domain yang ama-

    ama tidak memiliki item endomembran yaitu bakteria danarkhaea. al terebut membuat keduanya digolongkan dalam

    organime %rokariota. Prokariot modern memiliki truktur dan fungi

    +iologi yang beranekaragam. )eragaman %rokariot di%erkirakan

    /00.000 am%ai / milyar %eie. Penggunaan karakter fenoti%

    angat menyulitkan dalam menganalii kedua domain berbeda ini.

    Maka ara yang angat efektif adalah dengan menggunakan

    karakter molekular yang menghailkan data +logenetik. *engan

    membandingkan "#$ riboom dan data urutan lengka% genomnya

    maka %eneliti mam%u mengidenti+kai 2 abang utama evolui

    yaitu arkhaea dan bakteria.

    1

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    4/17

    Bakteria memiliki banyak anggota +lum dan ifat yang angat

    %enting untuk di%elajari. leh ebab itu( makalah ini dibuat untuk

    membantu mem%elajari a%ek-a%ek terebut.

    1.2. Rumusan Masalah"umuan maalah yang ingin dikaji dalam makalah ini adalah

    bagaimanakah iri umum domain bakteria dan item klai+kai

    +logeninya31.3. Tujuan

    *alam %enulian makalah ini( ada%un tujuannya adalah

    mengkaji iri umum domain bakteria dan item klai+kai

    +logeninya.

    BAB IIISI

    2

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    5/17

    2.1. ara!t"r Utama D#main Ba!t"riaBakteria adalah domain yang terdiri dari makhluk hidu% yang

    tidak memiliki membran inti ehingga diebut organime %rokariota.

    Bakteri dulu terbagi menjadi Bateria dan $rhaebateria( namun

    ekarang $rhaebakteria memiliki domain endiri yang diebut

    $rhaea. Bakteria memiliki iri-iri yang %aling umum antara lain

    tidak memiliki membran inti( tidak memiliki organel bermembran(

    memiliki dinding el %e%tidoglikan( dan materi aam nukleatnya

    beru%a %lamid dan nukleoid.Berikut meru%akan %erbedaan domain bakteria dengan

    arkhaea dan eukarya ,abel 1. Perbedaan karakter umum dalam item klai+kai &domain

    &

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    6/17

    Perbedaan utama *omain Bateria dengan $rhaea mau%un

    4ukarya terletak %ada aam amino iniiator yang diba5a oleh t"#$

    yang beru%a #-formylmethionine( eniti+ta riboom terhada%

    hloram%heniol dan kanamyin( tidak adanya %rotein hiton( dan

    keberadaan endo%ora.*engan menggunakan "#$ riboomal ub-unit keil %rokariota

    da%at diklai+kaikan ke dalam domain bakteria atau arkhaea.

    6ilogenetik %ada bebera%a takon %rokaryotik didaarkan %ada

    itematika molekular. Pelajaran %enting yang di%eroleh dari

    itematika molekular adalah nilai %enting dari tranfer gen

    horiontal dalam evolui %rokaryota. 'elama ratuan tahun

    %rokaryota mam%u mem%eroleh gen-gen dari %eie yang

    berkerabat jauh ekali%un. $kibatnya( uku% banyak genom dari

    %rokaryota yang meru%akan %roduk im%or moaik dari %eie lain.

     ,ranfer gen horiontal da%at mengaburkan lokai akar %ohon

    kehidu%an.ntuk menarik keim%ulan +logeni ahli itematika haru

    mengum%ulkan ebanyak-banyaknya data morfologi( gen dan

    biokimia dari organime domain bakteria yang relevan. Penentuankekerabatan didaarkan %ada homologi morfologi erta ekuen

    *#$. rganime dengan ekuen *#$ yang miri% mungkin lebih

    berkerabat dekat dari%ada dengan organime yang truktur

    ekuen *#$nya berbeda jauh.

    2.2. lasi$!asi D#main Ba!t"ria*omain bakteria terdiri dari bebera%a +lum. Berikut meru%akan

    anggota +lum dari domain bakteria diantaranya adalah +lum

    $idobateria( $tinobateria( $ui+ae( $rmatimonadete(

    Bateroidete( Caldieria( Chlamydiae( Chlorobi( Chloro:e;i(

    Chryiogenete( Cyanobateria( *eferribatere( *einoou-

     ,hermu( *ityoglomi( 4luimirobia( 6ibrobatere( 6irmiute(

    /

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    7/17

    6uobateria(

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    8/17

    yang relatif rendah. )ebanyakan berbentuk coccus  dan

    batang erta mam%u menghailkan endo%ora.e. 6ilum Chloro:e;i

    6ilum ini berifat miri% dengan bakteri ulfur hijau yang

    membedakan adalah terda%at chlorosom  dan berifat

    fototro+k. $nggota-anggotanya da%at tumbuh ebagai

    heterotrof atau%un fotointei. Memiliki jalur %eial untuk

    mem+kai C2 melalui jalur hydro%ro%ionat.

    f. 6ilum hlorobiMeru%akan bakteri ulfur hijau yaitu bakteri fotointetik

    yang tidak menghailkan okigen. Bebera%a berbentuk

    unieluler dan yang lain membentuk el-el. ,idak ada

    atu%un yang memiliki :agela.g. 6ilum yanobateria

    Meru%akan bakteri fotoautotrof dengan fotointei miri%

    dengan tumbuhan. 6ilum ini memiliki koloro+l a dan

    menggunakan 2 fotoitem untuk memeah air yang

    menghailkan okigen ebagai %roduk am%ingnya.

     ,erda%at bakteri yang hidu% di air ta5ar mau%un air laut.h. 6ilum aui+ae

    Meru%akan bakteri autotrof hidrogen. Meru%akan bakteri

    thermo+lik bahkan hi%erthermi+lik. Bakteri yang mem+kai

    C2 melalui iklu reduki aam nitrat dan menggunakan 2

    ebagai umber energinya.i. 6ilum thermotogae

    Meru%akan bakteria fermentatif yang terdiri dari bebera%a

    bakteri thermo+lik. Mam%u hidu% dan tumbuh %ada uhu

    AAC am%ai 90C. memiliki kandungan li%id dalam el yang

    kha. j. 6ilum +bobatere

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    9/17

    6ilum +brobaktere da%at ditemukan dalam ruminania

    he5an. Bebera%a %eie dari anggota +lum ini da%at

    mendegradai eluloa dari tumbuhan. mumnya

    meru%%akan bakteri anaerob gram negatif.

    2.3. R"%i"& 'urnal

    7

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    10/17

    8

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    11/17

    9

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    12/17

    10

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    13/17

    11

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    14/17

    12

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    15/17

    1&

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    16/17

    BAB IIIPENUTUP

    3.1. "sim(ulanCiri-iri umum domain Bakteria adalah aam amino iniiator

    yang diba5a oleh t"#$ yang beru%a #-formylmethionine(

    eniti+ta riboom terhada% hloram%heniol dan kanamyin( tidak

    adanya %rotein hiton( dan keberadaan endo%ora.*omain bakteria terdiri dari bebera%a +lum yaitu

    $idobateria( $tinobateria( $ui+ae( $rmatimonadete(

    Bateroidete( Caldieria( Chlamydiae( Chlorobi( Chloro:e;i(

    Chryiogenete( Cyanobateria( *eferribatere( *einoou-

     ,hermu( *ityoglomi( 4luimirobia( 6ibrobatere( 6irmiute(

    6uobateria(

  • 8/19/2019 Makalah Sistematika Mikrobia

    17/17

    DAFTAR PUSTAKA

    Madigan MT$ 9M Martinko$ 'A Stahl$ 'P :lark# /01/#  Brock Biology of 

     Microorganisms# 16th (dition# !enjamin :ummings# !oston# P 7;1

    Pres%ott 5M$ 9P