ppt cara penamaan enzim kel 3

Biasanya diberi akhiran –ase pada nama substrat atau reaksi yang dikatalisis

Contoh:Alkohol dehidrogenase: oksidasi alkoholUrease: hidrolisis ureaDNA polimerase: polimerisasi nukleotidaProtease: hidrolisis peptidaMetiltransferase: transfer gugus metil

Prinsip Penamaan

Enzim dikelompokkan dan diberi nama menurut reaksi yang dikatalisisnya.

Hanya merujuk pada perubahan reaksi kimia yang disebabkan oleh enzim.

Mekanisme reaksi tidak dimasukkan dan juga gugus prostetik atau kofaktor tidak masuk dalam nama.

Enzim mempunyai nama sistematis dan nama trivial.Nama trivial: lebih pendek, mudah dan sering

digunakan

Tata Nama• Menurut Enzyme Commission (1961), enzim dibagi

atas enam kelas tergantung pada reaksi yang dikatalisis.

• E.C.a.b.c.d– a. Kelas enzim– b. subkelas enzim– c. Sub-sub kelas enzim– d.Sub-sub-sub kelas enzim

• Pengelompokan tidak berdasarkan urutan asam amino, struktur tiga dimensi dan juga tidak berdasarkan mekanisme reaksi

KELAS ENZIM BERDASARKAN REAKSI KIMIA Kelas Tipe katalisis reaksi kimia contoh

Oksidoreduktase ReduksiOksidasi, melepas/mendapat O2 dan Hidrogen

Cytochrome oksidase, laktate dehydrogenase

Transferase Transfer grup, seperti grup amino, grup acetyl, grup phosphat

Acetate kinase, alanin deaminase

Hydrolase Hidrolisis (penambahan air) Lipase, sukrase

Lyase pemindahan grup atom tanpa hidrolisis Oksalat decarboxylase, isocitrat lyase

Isomerase Penataan atom menjadi molekul Glikose-phosphate isomerase

ligase Menyatukan dua molekul (mengambil energi, dari turunan ATP)

DNA ligase

b. Sub Kelas Enzim

• Digit kedua: Hidrogen atau donor elektron 1. Alkohol 2. Aldehid atau keton 3. CH-CH 4. Amin primer 5. Amin sekunder 6. NADH atau NADPHc. Sub-Sub Kelas enzim

• Digit ketiga: Hidrogen atau akseptor elektron 1. NAD+ atau NADP+

2. Fe 3+

3. O2

99. Akseptor lain

OksidoreduktaseNama sistematik ditulis menurut: donor:akseptor oksidoreduktase

EC. 1.1.1 Nama Sistematik: Alkohol:NAD+ oksidoreduktaseNama Trivial: Alkohol dehidrogenase

(Nama trivial: Oksidase, transfer H ke O2; dan dehidrogenase, untuk transfer H ke akseptor selain O2)

TransferaseMengkatalisis reaksi pemindahan berbagai gugus

fungsi seperti amino, karboksil, karbonil, metil, asil, glikosil, atau fosforil

A – X + B A + B – X Nama trivial yang umum seperti aminotransferase

(transaminase), transkarboksilase

HidrolaseMengkatalisis pemutusan ikatan secara hidrolitik

pada C-C, C-N, C-O dan ikatan lainnya Nama-nama trivial seperti esterase, peptidase,

amilase, fosfatase, urease, pepsin, tripsin, kimotripsin

Liase• Mengkatalisis pemutusan ikatan C-C, C-O, C-N, C-S. • Nama sistematik ditulis menurut substrat gugus liase.• Nama trivial, misalnya dekarboksilase, aldolase,

dehidratase (eliminasi CO2, aldehid, dan air).

Isomerase

• Mengkatalisis penataan struktur atau geometri dalam molekul.

• Nama-nama trivial seperti epimerase, resemase, dan mutase

LigaseMengkatalisis pengikatan (penggabungan) dua molekul,

disertai dengan hidrolisis senyawa yang mempunyai ΔG besar untuk hidrolisis

Energi yang diperlukan untuk pembentukan ikatan tersebut sering berasal dari hidrolisis ATP

Nama trivial : tiokinase dan karboksilase