Download - Struktur Protein
![Page 1: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/1.jpg)
STRUKTUR PROTEIN
OlehNursal Asbiran
Staf Pengajar FK UNBRAH
![Page 2: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/2.jpg)
Pendahuluan
• Berbagai fungsi protein dalam tubuh manusia berkaitan dengan struktur protein.
• .Protein katalitik, kekuatan sel untuk hidup, pembentukan makromolekul contoh hubungan struktur dg fungsiseperti batang yang membentuk tulang, gigi, rambu merupakan contoh hubungan struktur dg fungsi
• Untuk suatu fungsi biologis perlu proses pematangn dengan terjadinya pelipatan polipeptida jadi bentuk 3 dimensi (konformasi), terjadi penambahan gugus kimia baru
![Page 3: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/3.jpg)
Pendahuluan
• Genetik dan defisiensi nutrisi mempengaruhi maturasi protien, berdampak negatif pada kesehatan, seperti peny. Alzheimer, bovin spomgioform enchepalopathy (Peny sapi gila)
• Scurvy disebabkan defisiensi nutrisis pada maturasi protein
![Page 4: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/4.jpg)
Definisi
• Konformasi, berhubungan dg spasial atom dalam molekul
• Konfigurasi, hubungan geometri antara atom atom tertentu
![Page 5: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/5.jpg)
Klasifikasi protein berdasarkan bentuk
• Protein globular– Kompak, speris– Rasio panjang/ lebar tidak lebih dari 3.– Terbanyak berupa enzim. bermuatan, hidrofilik. Protein fibrous, rasio 10 atau lebih Lipoprotein, glikoprotein mengandung bagian lipid
dan karbohidratHemoglobin, mioglobin, sitokrom terikat kuat
dengan metal, disebut metalloprotein
![Page 6: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/6.jpg)
Terdapat 4 macam struktur protein
• Struktur primer urutan asam amino pada rantai polipeptida
Struktur sekunder pelipatan pendek (3 – 10 AA) polipeptidake letek geometri
Struktur tertierbentuk 3 dimensi struktur sekunder, unit fungsional , polipeptida matur
Struktur kuatenerjumlah dan tipe unit polipeptidadari oligoprotein dan susunan ruangnya.
![Page 7: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/7.jpg)
Struktur sekunder
• Rotasi bebas hanya tarjadi pada 2 dari 3 ikatan kovalen rangka polipeptida, yaitu
karbon alfa dg karbon karbonilkarbon alfa dg ikatan nitrogen
Ikatan rangkap menghambat rotasiBentuk struktur sekunder,
alfa heliksbeta sheetloop & bend
![Page 8: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/8.jpg)
Alfa Heliks
• Satu alfa helikas terbentuk dari 3 -6 aminoasil• Gugus R menghadap keluar• Protein hanya mengandung L AA, sehingga
kestabilan hanya bila helis memutar kekanan• Heliks memutar kekanan yang ada di alam.• Alfa heliks predominan hidrofobik, R hidrofilik, shg
amfipatik. • Sifat amfipatik memungkinkan terbentuk channel
atau poros sehingga molekul polar bisa melewati bagian hidrofobik.
![Page 9: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/9.jpg)
Beta sheet
• Bentuk plate struktur sekunder, gugus gugus R terletak pada posisi berlawanan
• Lembar terlipat beta bisa paralel atau anti-paralel
![Page 10: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/10.jpg)
Loop & Bend
• Separuh dari protein globular berupa alfa heliks dan beta sheet, dan separuh lagi berupa loop(gelungan beta), turn, bend (tekukan beta) dan bentuk konformasi lain.
• Regio gelungan ( loop) membentuk tapak pengikatan antigen.
![Page 11: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/11.jpg)
Strukrur tertier dan kuatener
• Struktur tertier (ST) merefer ke konformasi 3 adalah satu satu struktur tertier.dimensi
• Sufisien untuk membentuk gugus kimia khusus atau kerja fisik spt berikatan dengan substrat atau gugus lain.
• Dapat membangun membran sel , atau berinteraksi dengan molekul pengatur.Mioglobin, triosa fosfat isomerase adalah ST tunggal.
![Page 12: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/12.jpg)
Struktur tertier dan kuatener
• Protein kinase terdiri dari 2 ST mengkatalisis pemindahan fosfat dari ATP ke peprtida atau protein.
• Bagian amino ujung polipeptida kaya beta sheet, dapat mengikat ATP, sedangkan bagian karboksil ujung yang kaya alfa heliks mengikat peptida atau protein.
• Adakalanya protein tidak hanya terdiri dari satu polipeptida atau protomer.
![Page 13: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/13.jpg)
• Struktur kuatener (SK)adalah komposisi polipeptida dari suatu protein untuk membangan protein oligomerik dimana terdapat kaitan antara 2 protomer
• Protein Monomerik td 1 polipeptida• Dimerik td 2 polipetida• Dst
![Page 14: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/14.jpg)
Faktor yang menstabilkan ST dan SK
• Interaksi nonkovalen , inter aksi hidrofobik dari rantai samping AA ke bagian dalam protein.
• Ikatan hidrogen dan ikatan garam antara karboksil aspartat dan glutamat dg muatam berlawanan dari lisil, arginil dan histidil
• Ikatan kovalen (relatif lemah)• Ikatan disulfida residu sisteinil
![Page 15: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/15.jpg)
Denaturasi
• Pemberian asam atau basa dan pemanasan akan merusak SS, ST dan SK
• Protein terdenaturasi dapat mengalami renaturasi . Anfinsen berpendapat bahwa struktur primer protein sendiri sudah cukup mengarahkan pelipatan protein.
![Page 16: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/16.jpg)
KOLAGEN
• Melukiskan hubungan struktur dan fungsi yang beragam.
• Tropokolagen merupakan molekul tripel heliks yg kaya glisin, prolin dan OH-prolin.
• Setiap residu ke tiga adalah glisin• Ikatan silang kovalen menstabilkan serabut
kolagen Gangguan gizi dan genetik terjadi akibat gangguan SS.
![Page 17: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/17.jpg)
Defek kolagen
• Defisiensi Nutrisi. • vitamin C menyebabkan scurvy• Defisiensi OH prolin, OH lisinengkak
kolagen tak stabil, terjadi perdarahan sendi bengkak, penyembuhan penyakit lama, Bila berat bisa menyebablan kematian.
![Page 18: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/18.jpg)
Defek ….
• Sindrom MenkesTerjadi karena defisien Cu, yang dibutuhkan lisil oksidase.Gangguan covalent cross-link (pengencangkan serabut kolagen)Rambut halusGrowth retardasi
![Page 19: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/19.jpg)
Defek ……. • Gangguan biosintesis kolagen terjadi
osteogenik imperfectatulang fragil
Sindrom Ehlers Dahlospenyakit jaringan ikatintegritas struktur tak terjadimobil jointSkin abnormalitis
![Page 20: Struktur Protein](https://reader036.vdokumen.net/reader036/viewer/2022082402/5695d0371a28ab9b02917a5b/html5/thumbnails/20.jpg)
TERIMA KASIH