presentasi enzimologi (ki- 5162 ) “ gliserol kinase “ e.c 2.7.1.30

14
PRESENTASI ENZIMOLOGI (KI-5162) “GLISEROL KINASE “ E.C 2.7.1.30 Beta Zahra Al Husna 10507009

Upload: ania

Post on 24-Feb-2016

76 views

Category:

Documents


1 download

DESCRIPTION

PRESENTASI ENZIMOLOGI (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase “ e.c 2.7.1.30. Beta Zahra Al Husna 10507009. AGENDA PRESENTASI. PENDAHULUAN TATA NAMA ENZIM STRUKTUR ISOLASI PEMURNIAN MEKANISME KINETIKA INHIBISI. PENDAHULUAN. GLISEROL. - PowerPoint PPT Presentation

TRANSCRIPT

Page 1: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

PRESENTASI ENZIMOLOGI (KI-5162)“GLISEROL KINASE “

E.C 2.7.1.30

Beta Zahra Al Husna10507009

Page 2: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

AGENDA PRESENTASI• PENDAHULUAN• TATA NAMA ENZIM• STRUKTUR• ISOLASI• PEMURNIAN• MEKANISME• KINETIKA• INHIBISI

Page 3: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

PENDAHULUAN

• Gliserol : produk metabolisme jaringan adiposa (glukoneogenesis)

• Hanya dapat digunakan oleh jaringan yang memiliki enzim pengaktifnya yaitu : GLISEROL KINASE

GLISEROL

Page 4: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

• E.C 2.7.1.30

• Nama sistematik : ATP: glycerol-3-phosphotransferase

• Nama trivial : Gliserol kinase

TATA NAMA ENZIM

Kelas transferase

Sub kelas fosfotransferase

Sub sub kelas fosfotransferase

Nama dari GK

Page 5: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

Struktur domain dan daerah tempat berikatannya efektor

pada GK

Tempat berikatannya ADP & gliserolSTRUKTUR

• Sumber : Eschericia coli • Protein oligomer yang

tetramer (terdiri dari 4 subunit yang identik).

• Daerah aktifnya mengandung ADP dan gliserol pada satu unitnya.

• Berat molekul enzim : 217,000

• Berat molekul subunit : 55,000

Page 6: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

Ikatan hidrogen

Ikatan van der waals

Ikatan Mg2+

Hidrolisis ATP

TOPOLOGI STRUKTUR

Page 7: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

ISOLASIstarter

(kultur pH 7,0)

Dipindahkan ke medium 100 L dalam fermentor

(37oC, 5 kubik feet/min, 8-12 jam)

Kultur dipindah ke bak dingin yang berisi sel yang dipanen dengan Sharples sentrifuga

Sel dicuci dengan buffer

standar pH 7,0 (4oC)

Berat bersih (745 g)

pemurnian Karakteristik protein

Page 8: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

Sel 745 gr (4oC) disuspensi dalam 2

ml buffer

Homogenat disentrifuga 20

min (48.000 x g)

Ultrasentrifuga (100.000 x g, 1 jam)

Suspensi diaduk

semalam

Presipitat dihilangkan dgn sentrifugasi (30.000 x g, 30 min), supernatan

difraksinasi dgn (NH4)2SO4

Fraksi (NH4)2SO4 didilusi dgn buffer 0,1 M KCl (36

jam) ke kolom DEAE-selulosa (500 ml)

Protein dielusi dgn 1650 ml buffer 0,1 M KCl (mixing chamber) &

1650 ml buffer 0,25 M KCl (reservoir)

Konsentrat (NH4)2SO4 didilusi dalam kolom

Sephadex-200 dengan buffer

Diawasi dgn ultraviolet analyzer 280 nm

Elektroforesis 2-D (gradien

pH)

PEMURNIAN

Page 9: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30
Page 10: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

MEKANISMEReaksi aktivitas gliserol dengan gliserol kinase

Transfer fosfat dari ATP

Page 11: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

KINETIKA

Page 12: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

INHIBISI• GK terinhibisi secara alosterik oleh

fruktosa bifosfat (FDP).• Inhibisi dengan FDP

nonkompetitif

PENGENDALIAN INHIBISI• Inhibisi gliserol kinase oleh FDP dapat direduksi

dengan:1. memanipulasi kondisi ioniknya2. dilakukan mutasi

Page 13: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

1. Manipulasi kondisi ionik : menggunakan garam (misal: KCl) konsentrasi tinggi menurunkan sensitivitas dan stimulasi terhadap FDP.

Pengaruh KCl terhadap reaksi gliserol kinase Pengaruh garam lain terhadap reaksi gliserol kinase

2. Dilakukan mutasi

Page 14: PRESENTASI ENZIMOLOGI  (KI- 5162 ) “ Gliserol kinase  “ e.c 2.7.1.30

SEKIAN DANTERIMA KASIH