keragaman mikroorganisme 2 - · pdf filedalam taksonomi, picrophilus adalah genus archaean...

14
Keragaman mikroorganisme 2 ( prokaryotz/archaea &eukaryote ) Kelompok e

Upload: nguyentuyen

Post on 06-Feb-2018

264 views

Category:

Documents


2 download

TRANSCRIPT

Page 1: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Keragaman mikroorganisme 2

( prokaryotz/archaea &eukaryote )

Kelompok e

Page 2: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Natronobacterium

klasifikasi ilmiah:

Domain: Archaea

Raya: euryarchaeota

Filum: euryarchaeota

Kelas: Halobacteria

Order: Halobacteriales

Keluarga: Halobacteriaceae

Genus: Natronobacterium

Tindall et al.

Page 3: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Dalam taksonomi, Natronobacterium adalah genus dari Halobacteriaceae.

Seorang anggota dari domain Archaea, itu adalah baik halophile ekstrim dan

alkalifili, berkembang pada konsentrasi garam optimum dari 20% dan pH optimum

dari 10.

Page 4: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

klasifikasi ilmiah:

Domain: Archaea

Raya: euryarchaeota

Filum: euryarchaeota

Kelas: Methanobacteria

Order: Methanobacteriales

Keluarga: Methanobacteriaceae

Genus: Methanobacterium

nama binomial: Methanobacterium

Kluyver dan van Niel 1936

Page 5: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Para ilmuwan telah diurutkan Methanopyrus kandleri, organisme berbentuk batang yang menghasilkan metana dan tumbuh optimal pada suhu dekat dan di atas titik didih air. mikroba diisolasi dari dasar laut di dasar cerobong 'perokok hitam' di Teluk California. Ini adalah anggota dari keluarga archaea, cabang kuno hidup yang berbeda dari tanaman, hewan, dan bakteri. Methanopyrus kandleri. Courtesy K.O. Stetter, R. Huber & R. Rachel, Univ. Regensburg, Jerman. Methanopyrus kandleri memiliki relatif sedikit gen ditransfer dari organisme lain dibandingkan dengan archaea lainnya. Hal ini mungkin karena lingkungan ekstrim M. kandleri, yang akan membatasi kemampuannya untuk bertukar gen dengan organisme lain. Urutan termasuk 1,7 juta pasangan basa dan sekitar 1.690 gen. Para peneliti membandingkan urutan dengan yang metanogen sequencing lainnya untuk mengidentifikasi satu set yang berbeda dari gen karakteristik metanogen archaea. Organisme lain yang Methanococcus jannaschii dan Methanothermobacter thermoautotrophicum.

Page 6: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Methanosarcina

Methanosarcina barkeri Fusaro

klasifikasi ilmiah:

Domain: Archaea

Raya: euryarchaeota

Filum: euryarchaeota

Kelas: Methanomicrobia

Order: Methanosarcinales

Keluarga: Methanosarcinaceae

Genus: Methanosarcina

nama binomial: Methanosarcina

Kluyver dan van Niel 1936

Page 7: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Methanosarcina adalah genus archaea euryarchaeote yang menghasilkan metana. Organisme bersel tunggal yang dikenal sebagai

metanogen anaerob yang menghasilkan metana menggunakan semua

tiga jalur metabolisme untuk methanogenesis. Mereka tinggal di

lingkungan yang beragam di mana mereka dapat tetap aman dari efek

oksigen, baik di permukaan bumi, di tanah, di ventilasi laut dalam, dan

dalam saluran pencernaan hewan. Methanosarcina tumbuh di koloni.

The pyrrolysine asam amino pertama kali ditemukan pada spesies

Methanosarcina, M. barkeri. versi primitif dari hemoglobin telah

ditemukan di M. acetivorans, menunjukkan mikroba atau nenek moyang

itu mungkin telah memainkan peran penting dalam evolusi kehidupan di

Bumi. Spesies Methanosarcina juga dicatat untuk genom yang luar biasa

besar. M. acetivorans memiliki genom terbesar yang diketahui dari archaeon apapun.

Page 8: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Picrophilus

klasifikasi ilmiah:

Domain: Archaea

Raya: euryarchaeota

Filum: euryarchaeota

Kelas: Thermoplasmata

Order: Thermoplasmatales

Keluarga: Picrophilaceae

Genus: Picrophilus

nama binomial: Picrophilus

Schleper et al. 1996

Page 9: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Dalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae.

Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota. mikroba ini adalah organisme

yang paling acidophilic saat ini dikenal, dengan kemampuan untuk tumbuh pada pH -0,06. Mereka

pertama kali diisolasi dari sampel yang diambil dari mata air panas asam dan tanah panas kering di

Hokkaido (Jepang). Mereka asidofili wajib dan tidak mampu mempertahankan integritas membran

mereka pada nilai pH lebih tinggi dari. Sementara filogenetis terkait dengan organisme lain dalam

Thermoplasmata, tidak seperti Thermoplasma dan Ferroplasma, Picrophilus berisi dinding sel S-

layer.

Dalam taksonomi, yang Thermoplasmatales merupakan urutan Thermoplasmata. Semua yang

asidofili, tumbuh optimal pada pH di bawah 2. Picrophilus saat ini acidophilic kebanyakan dari

semua organisme diketahui tumbuh pada pH minimum 0,06. Banyak organisme ini tidak

mengandung dinding sel, meskipun hal ini tidak benar dalam kasus Picrophilus. Sebagian besar

anggota Thermotoplasmata yang termofilik.

Page 10: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Thermococcus kodakarensis

klasifikasi ilmiah:

Domain: Archaea

Raya: euryarchaeota

Filum: euryarchaeota

Kelas: Thermococci

Order: Thermococcales

Keluarga: Thermococcaceae

Genus: Thermococcus

Spesies: T. kodakarensis

nama binomial: Thermococcus kodakarensis

Atomi et al, 2004

Thermococcus kodakarensis adalah spesies archaea termofilik. Jenis galur T. kodakarensis KOD1 adalah salah satu anggota dipelajari terbaik dari genus.

Page 11: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Thermococcus kodakarensis adalah spesies archaea termofilik. Jenis galur T. kodakarensis KOD1 adalah salah satu anggota dipelajari terbaik dari genus.

T. kodakarensis diisolasi dari solfatara di dekat pantai Kodakara Island, Kagoshima, Jepang. Isolat awalnya bernama Pyrococcus kodakarensis KOD1, tapi direklasifikasi sebagai spesies Thermococcus, berdasarkan 16S rRNA urutan. Penelitian awal dengan T. kodakarensis diarahkan sebagian besar pada enzim termostabil, tetapi relatif mudah atas penanganan dan manipulasi genetik difasilitasi oleh kompetensi alami telah membuatnya menjadi sistem yang menarik untuk studi dari beberapa proses biologis.

sel T. kodakarensis tidak teratur cocci 1-2 m dengan diameter, sering terjadi di pasang, dan sangat motil dengan cara flagella lophotrichous. Dinding sel terdiri dari lapisan di-eter dan lipid tetra-eter, dan mantel glikoprotein luar. T. kodakarensis adalah anaerob obligat, dan heterotrof, tumbuh cepat pada berbagai substrat organik di hadapan elemen sulfur, menghasilkan gas hidrogen sulfida. Waktu generasi diperkirakan 40 menit dalam kondisi optimum. Persyaratan untuk elemen sulfur adalah lega ketika piruvat atau pati digunakan untuk pertumbuhan. Dengan tidak adanya sulfur, hidrogen diproduksi bukan hidrogen sulfida. Pertumbuhan ini dimungkinkan pada suhu berkisar 60-100 ° C, dengan optimum pada 85 ° C. Seperti organisme laut lainnya, konsentrasi garam yang tinggi diperlukan untuk pertumbuhan optimal, dan lisis sel dapat terjadi dalam solusi encer.

Page 12: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Methanopyrus

klasifikasi ilmiah:

Domain: Archaea

Raya: euryarchaeota

Filum: euryarchaeota

Kelas: Methanopyri

Order: Methanopyrales

Keluarga: Methanopyraceae

Genus: Methanopyrus

nama binomial: Methanopyrus

Kurr et al. 1992

Page 13: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Dalam taksonomi, Methanopyrus adalah genus dari Methanopyraceae.

Methanopyrus adalah genus metanogen, dengan spesies dijelaskan tunggal, M.

kandleri. Ini adalah hyperthermophile, ditemukan di dinding perokok hitam dari

Teluk California pada kedalaman 2.000 m, pada suhu 84-110 ° C. Strain 116

ditemukan dalam cairan perokok hitam bidang hidrotermal Kairei; itu dapat

bertahan hidup dan bereproduksi pada 122 ° C. Ia tinggal di lingkungan yang

kaya hidrogen-karbon dioksida, dan seperti metanogen lain mengurangi

terakhir untuk metana. Hal ini ditempatkan di antara euryarchaeota, di kelas

sendiri..

Page 14: Keragaman mikroorganisme 2 - · PDF fileDalam taksonomi, Picrophilus adalah genus Archaean dari keluarga Picrophilaceae. Picrophilus adalah genus sangat acidophilic dalam euryarchaeota

Kelompok E:

Sisca nirmala sari/ 160401087

sandita mahdani/160301088

debi Chandra siagian/160301089

elisa Christy panjaitan/160301090

aulia risky rahmadani/160301091

sri noviani/160301092

annur alhayu/160301093