k.8-9 asam nukleat

18
ASAM NUKLEAT (NUCKEIC ACID) Terdapat pada semua sel hidup Merupakan makromolekul dengan monomer Mononukleotid Fungsi 1. Menyimpan, mereplikasi dan mentranskripsi informasi genetika 2. Turut dalam metabolisme 3. Penyimpanan energi 4. Sebagai ko-enzim Struktur Asam Nukleat 1. Hidrolisis Asam Nukleat Nukleotida Parsial Nukleosida Asam Fosfat Total Basa Purine Gula : Ribosa 1

Upload: missirena

Post on 18-Dec-2015

241 views

Category:

Documents


2 download

DESCRIPTION

NUCLEIC ACID

TRANSCRIPT

  • ASAM NUKLEAT (NUCKEIC ACID)

    Terdapat pada semua sel hidupMerupakan makromolekul dengan monomer Mononukleotid Fungsi 1. Menyimpan, mereplikasi dan mentranskripsi informasi genetika 2. Turut dalam metabolisme 3. Penyimpanan energi 4. Sebagai ko-enzimStruktur Asam Nukleat 1. Hidrolisis Asam Nukleat Nukleotida Parsial

    Nukleosida Asam Fosfat

    TotalBasa Purine Gula : Ribosa &Pirimidin atau Deoksiribosa

    1

  • H HO HOCH2HOHOHHOH - D - ribosa H HO HOCH2HOHHHOH-2 deoksi D- ribosa 2Gula

  • 3. Basa purin dan pirimidin

    CHH N

    N

    HNNHPurin

    NH2

    NNNHCHN Adenin(6-aminopurin)NH

    / H2N|N O ||NCHNH ||Guanin(2 amino 6 oksipurin)O||

    HN

    NCHNHHipoksanium

    NO|| N CH

    N N H

    H3C NN H CH3 C=C HN-CH3 CH3 N CH NN

    NH1 metil hipoks IantinN(6 ^ sopentenil)adenin

  • CH3 | O HCOH || | O O HN-C-NH-C-COOH || ||NNCHNNH HNN CHNHNH2CNH2CH2CNH2NNNCHNHNN6-dimetil guanin1-metil guaninTreonil karbonil adenin 4 3 5 2 6 1 4 H N H H H NPirimindin

    OO

    Sitosin

    HH(2-oksi-4-aminoprimidin)NH

    Urasil2,4-dioksipirimidin)HNHHHOOHNO

    O O ONHNH Timin(5-metil-2-4dioksipirimidin)NH NONH

  • HN O N H NH2N CH3H N H O5-metil sitosin O N H

    NH2

    NCH2OH ONH5 hidroksimetil sitosinDihidrourasilOH2H2

    HNO N HS4-tiourasil OHOCH2HH H HOH OH OH N NH

    N Pseudo uridin OH

  • 4. Nukleosida : Senyawa antara purin dan pirimidin dengan ribosa dan deoksiribosa

    Beberapa nama nukleosida4

    Basa RibonuklleosidaDeoksiribonukleosidaAdeninGuaninUrasilSitosinTimidinAdenosinGuanosinUridinSitidinTiminRibonukleotida2 -deoksiadenosin2 -deoksiadenosin2 -deoksiuridin2 -deoksitidin2 -deoksitimidin

  • 5. NUKLEOTIDA : Ester nukleosida dengan asam fosfat Singkatan nama beberapa nukleotida 5

    BASA RIBONUKLEOSIDAMONOFOSFATDIFOSFATTRIFOSFATAdeninGuaninSitosinUrasilAMPGMPCMPUMPADPCDPCDPUDPATPGTPCTPUTP

    BASA RIBONUKLEOSIDAMONOFOSFATDIFOSFATTRIFOSFATAdeninGuaninSitosinTimin dAMPdGMPdCMPdTMPdADPdCDPdCDPdTDPdATPdGTPdCTPdTTP

  • Nukleotida yang penting : AMP, ADP, ATPSebagai pembawa energi Penting dalam penyimpanan dan pemanpaatan energi selama metobolismesel.ATP pembawa energi utama dalam sel :ADP + Pa ATP ( fosforilasi oksidatif)

    EnergiATP + H2O ADP + Pa (as. Fosfat) + energi (hidrolisis)Fungsi nukleotida :

  • Adenosin 5-monofosfatAdenonin 5-disfosfat Addenosin 5-trifosfatStruktur AMP,ADP dan ATP OH OH OH | | |HO- P- O-P- O- P- O- CH2 |||| || || O O O OHOHOHNH2NCHNNNHHOH

  • 2. Pembawa bahan pembentuk dasar suatu molekul. Contoh :Nukleotida Urin Difosfat (UDP) untuk sintesis glikogenKolin Sitidin Difosfat sistesis kolin fosfolipidNukleotida trifosfat (NTP) sintesis DNA dan RNA

    3. Sebagai ko enzim:Nikotamida Mono Nukleotida (NMN), merupakan vitaminFlavin Mono Nukleotida (FMN) koenzim proses oksidasi reduksi pada respirasi sel- Nikotinamida Adenin Dinukleotida (NAD), Flavin Adenin Dinukleotida (FAD) koenzim proses oksidasi- reduksi

    . ASAM NUKLEATMerupakan polimer (polinukleotida) dari mononukleotida Ada 2 macam : 1. DNA (Asam Deoksitibonukleat) gulanya deoksiribosa 2. RNA (Asam Ribonukleat) gulanya ribosa

    6

  • DNA : Makromolekul dengan Mr yang sangat besar.Terdiri da mononukleotida utama : dAMP, dGMP, Dtmp, dCMP- Terdiri dari dua atau lebih rantai polinukleotida yang tersusun dalam struktur heliks (heliks ganda) GAMBAR STRUKTUR DNA

  • Setiap spesies/organisme mononukleotida utamanya mempunyai perbandingan, urutan dan berat molekul (Mr) yang spesifikPada sel prokariotik (mengandung hanya satu kromosom) DNA nya merupakan makromolekul tunggal dengan Mr = 2 x 109Pada sel eukariotik (mengandung banyak kromosom) mempunyai banyak molekul DNA dengan Mr yang sangan besar.DNA terutama terdapat dalam inti sel (DNA inti) bergabung dengan protein histonJuga bisa terdapat pada sitoplasma (DNA sitoplasma), dalam mitokondria, dalam kloroplas.Pada sel bakteri selain terdapat dalam inti sel juga bisa pada sel membran = mesosom dan dalam sitoplasma di luar kromosom = plasmid/episomDNA normal dari suatu spesies yang berbeda menunjukkan adanya keteraturan (regularitas) CHARGAFFS RULES: 1. Komposisi basa dari DNA suatu organisme adalah tetap pada semua sel nya dan mempunyai karakteristik tertentu. 2. Komposisi basa dari DNA bervariasi dari satu organisme dengan organisme lainnya. dinyatakan dengan dissymmetry ratio : (A+T)/(G+C)

  • Table 15.3. The Composition of DNA from Vario Sources

    Base Composition (%)A T G CBaser RatiosA/T G/C Pu/PyDissymmetry Ratio (A+T)/(G+C)Human CalfSheepRatHenTurtleSalmonManne crabSea urchinYeastApergilus niger (mold)Eschenchra coliStaphylococus aureus30.9 29.4 19.9 19.829.0 28.5 21.1 12.129.3 28.3 21.4 21.028.6 28.4 21.4 21.528.8 29.2 20.5 21.529.7 27.9 22.0 21.329.7 29.1 20.8 20.4473 473 27 2732.8 32.1 17.7 17.331.3 32.9 18.7 17.1 25.0 24.9 25.1 25.024.7 23.6 26.0 25.730.8 29.2 21.0 19.0 1.05 1.00 1.041.01 1.00 1.001.03 1.02 1.031.01 1.00 1.001.02 0.95 0.971.05 1.05 1.001.02 1.02 1.021.00 1.00 1.001.02 1.02 1.020.95 1.09 1.001.00 1.00 1.001.04 1.01 1.031.05 1.11 1.07 1.52 1.36 1.36 1.33 1.38 1.33 1.43 17.52 1.85 1.79 1.00 0,93 1.50

  • 3. Komposisi basa dari sutau spesies tidak berubah oleh umur, keadaan nutrisi, ataupun lingkungan.4. Jumlah adenin dalam DNA suatu organisme selalu sama dengan jumlah timin (A=T)5. Jumlah guanin dalam DNA suatu organisme selalu sama dengan junlah sitosin (G=C).6. Jumlah total basa purin dalam DNA suatu organisme selalu sama dengan jumlah total basa pirimidin : (A+G) = (T+C)RNA Terdiri dari rantai tunggal poliribonukleotidaHampir seluruhnya terdapaat di sitoplasma, juga terdapat pada virusRantai tunggal Chargaffs Rules tidak berlakuAda 3 macam : tRNA (transfer-RN mRNA (messenger-RNA) rRNA (Ribosomal-RNA)

  • tRNA molekulnya kecil basanya : A,G dan U yang termetilasi jumlahnya hanya sedikit dari total RNA dalam sel mengangkut (trasport) asam amino spesifik ke ribosom untuk proses sintetis protein.

    mRNA basanya ; A,G,C dan U disintetis dalam inti sel pada proses transkripsi pembawa informasi genetik dari DNA untuk sintetis protein umurnya pendek mengalami degrasasi/resintetis.

  • rRNA bagian terbanyak dari RNA dalam sel (80%) merupakan 60 % dari beraat ribosom basa utamanya : A,G,C,U fungsinya belum jelas

    7. HIDROLIS ASAM NUKLEAT

    1. Hidrolisis dengan enzim enzim nuklease, yang terdiri dari: a. enzim eksonuklease menyerang ujung rantai polinukleotida b. Enzim endonuklease menyerang bagain dalam rantai2. Hidrolisis dengan asam/basaHidrolisis DNA dengan asam terbentuk asam apurinat (DNA tanpa purin) dan asam apirimidat (DNA tanpa pirimidin)DNA tidak dihidrolis oleh basaHidrolisis RNA dengan basa memutuskan ikatan gugus hidroksil 2 ribosa

    7

  • 8. NUKLEOPROTEIN- Gabungan asam nukleat + protein mempunyai struktur/aktifitas yang kompleks.Mr nya tinggi Contoh terkenal : virus dan ribosomVIRUS : * Kompleks supra molekul :asam nukleat + unit protein, membentuk susunan 3 dimensi * Dapat diisolasi, tapi tak bisa memperbanyak dirinya. Untuk memperbanyak diri harus masuk ke dalam sel khusus induk semangnya memaksa induk semang untuk men sintetis komponen yang diperlukannya sintesis ke - butuhan induk semang tergeser * Virus tanaman ; terdiri dari RNA Virus hewan : terdiri dari RNA & DNA

    8.

  • - RIBOSOM : * Sel prokariotik : 60 % Rrna + 50 % protein * Sel eukariotik : 50 % Rrna + 50 % protein, umumnya lebih besar, terdapat dalam sitoplasma bergabung deng organel retikulum endoplasma * Juga terdapat dalam inti sel dan organel lain (mitokhondria & khloroplast)