3. aksi gen (ekspresi gen)

Upload: serafineama

Post on 02-Mar-2016

486 views

Category:

Documents


34 download

DESCRIPTION

ekspresi gen

TRANSCRIPT

PERTEMUAN II

PERTEMUAN II29 SEPTEMBER 2011EKSPRESI GENAditif

Non aditif dominan lengkap, kurang dominan (semi dominan), lewat dominan, co dominan (intermediate) dan epistasisEkspresi Gen AditifTidak menampakkan perbedaan fenotipe yg mencolok bersifat saling menambahkanContoh : beberapa gen mempengaruhi suatu sifat yg dapat diukur (misal bobot badan)Setiap gen besar memberikan kontribusi 10 unit bobot badan dan gen kecil 5 unit AaBBCCdd : fenotipe bobot badan = 50 +15 = 65 unit AABBCcDd : 60 + 10 = 70 unitEkspresi Gen Non AditifDominan lengkap (dominan penuh) suatu gen mampu menutupi gen pasangannya (alelenya)Contoh :- warna kulit sapi FH hitam dominan terhadap merah genotipe BB atau Bb = hitam dan bb = merah- wool domba Suffolk putih sbg gen dominan dan hitam sbg resesif genotipe WW atau Ww = putih dan ww = hitam Contoh Karkter Dengan Aksi Gen Dominan

Contoh Karkter Dengan Aksi Gen Dominan

Aksi Gen Kurang Dominan (Semi Dominan) Terjadi karena kekurangmampuan suatu gen dlm mengekspresikan dirinya sendiri terhadap pasangannya (alele)Hetrosigot bersifat di antara (intermediate) individu dominan dg resesifSetiap genotipe memiliki phenotipe yang dapat dibedakanSetiap alele menghasilkan produk yang sama namun dalam kadar yang lebih rendah dibanding dg dominanRasio phenotipe (sepasang gen) 1 : 2 : 1 sebagai ganti 3 : 1 pada dominan

Aksi Gen Co Dominan (Intermediate)Terjadi karena gen dominan dan resesif sama- sama punya kekuatan yg seimbang utkmengekspresikan fenotipe1. Kedua alele mengekspresikan diri dalam bentuk heterosigot2. Ekspresinya berbeda, karena asam aminonya berbeda3. Namun fungsi kedua alele sama

Contoh :

1. Golongan darah manusia (antigen A dan B) A/AB = tipe AB Silangan AA x ABAB

AAB x AAB

AA + AAB + ABAB Hasil rasio phenotipe 1 : 2 : 1

2. Rambut kulit sapi Shorthorn : Genotipe RR = fenotipe warna rambut merah Genotipe rr = fenotipe warna rambut putih Genotipe Rr = fenotipe warna rambut roan (kombinasi warna merah dan putih)

Aksi Gen Lewat DominanInteraksi antar gen yg menyebabkan individu heterosigot punya penampilan yg lebih baik dibandingkan homosigotEkspresi gen ini bertanggungjawab terhadap hybrid vigorEpistasisMerupakan interaksi antar gen yg bukan pasangannya (gen yg berada pd lokus yg berbeda) suatu gen dapat menutup pengaruh gen lain yg bukan alelenyaNisbah fenotipe biasanya tidak sesuai dengan hasil yg diperoleh oleh MendelEpistasis dominan pengaruh suatu gen dominan dapat menutupi pengaruh gen dominan lainEpistasis resesif suatu gen resesif dapat mengalahkan pengaruh gen dominan yg bukan alelenyaContoh nisbah fenotipe pd F2Epistasis dominan: 12 31Epistasis resesif: 9 34Duplikat epistasis dominan: 151Duplikat epistasis resesif: 97B B ------------------------------------------ B BB (black) BB (black) B BB (black) BB (black) 100% black > All of the puppies are black if both parents are BB (pure for black).

Now suppose the sire is pure for black but the dam carries a recessive gene for brown. In this case see can produce either black or brown gametes, so

B B --------------------------------------------------------B BB (pure for black) BB (pure for black) b Bb (black carrying brown) Bb (black carrying brown) 100% blackThis gives approximately > a 50% probability that any given puppy is pure for black, and > a 50% probability that it is black carrying brown. > All puppies appear black. > We can get essentially the same diagram if the sire is black carrying brown and the dam is pure for black. Sekarang : andai kedua parent (tetua) hitam karier coklat maka F1 menjadi :

B b -----------------------------------------------------B BB Bb (pure for black)(black carrying brown)

b Bb bb (black carrying brown) (brown)

The ratio on average : 3 (black) : 1 (brown)

Another possible mating would be pure for black with brown :B B--------------------------------------------------------------------b Bb (black carrying brown) Bb (black carrying brown) b Bb (black carrying brown) Bb (black carrying brown) all (100%) black In this case, all the puppies will be black carrying brown.

Suppose one parent is black carrying brown and the other is brown :

B b --------------------------------------------------------------b Bb (black carrying brown) bb (brown) b Bb (black carrying brown) bb (brown) 50 : 50%

Crossing with Dominance Gen Actions

Heterozygote Crossing

Beberapa Masalah SilanganMonohibrid Seandainya peternak mempunyai tiga jenis (warna bulu) masing-masing dengan genotipe :

AA (hitam)Aa (hitam karier coklat)aa (coklat, resesif)

Pertanyaan :Berapa kemungkinan kombinasi silangan dalam populasi ternak tsb ?Silangan Monohibrid (Dengan Aksi Gen Dominan)KombinasiSilanganGamet (P1)Gamet (P2)FrekuensiGenotipe(Pada Progeni)AA x aaAaSemua Aa (100%)Aa x AaA dan aA dan a1/4 AA, Aa + 1/4aaAa x AAA dan aA AA, AaAa x aaA dan aa1/2Aa, aaKombinasi lain ?Apakah ada model silangan selain ke empat silangan di atas ???Lanjutan slide : Bandingkan Rasio Phenotipe bila : Frekuensi GenotipeDominan lengkapSemi dominanAa 100%Semua dominanSemua semi dominan AA, 1/2Aa, 1/4aa3 : 11 : 2 : 1 AA, AaSemua dominan1 : 1 Aa, aa1 : 11 : 1Pada semi dominan : alele yang ada menghasikan (ekspresi) satu sifat yang sama, namun dalam kwantiti yang lebih rendahMasalah lain : Pewarisan DominanBBBbbbBBBbbbJantan (Bull)IndukSapi(Cow)

9 BB9 Bb9 Bb9 bb27 black : 9 redsDimana Masalahnya ???ProgeniesBerdasar Tabel (di atas) diperoleh :1. Pewarisan dominan tidak efektif 100% dalam program breeding (khususnya seleksi)

karena alasan :> phenotipenya tidak merefleksi genotipenyaoleh karena itu performan progeninya lebih efektif (perlu dilakukan uji Progeny / progeny testing)

> Lalu, pewarisan atau aksi gen apa yang lebih efektif ???Genetika MolekulerSel yg membangun tubuh makhluk hidup mengandung inti selInti sel mengandung sejumlah kromosomDi dlm kromosom terdapat lokus-lokusDi dlm lokus terdapat gen-genGen sbg unit terkecil pembawa sifat keturunanKromosom tersusun atas protein dan DNADasar GenetikaDasar dalam kehidupan terletak pada molekul yang sangat besar yang disebut asam deoksiribonukleat (DNA)Sebuah molekul yang terkait, asam ribonukleat (RNA) menyediakan bahan genetik untuk beberapa mikroba, dan juga membantu DNA untuk membuat protein.

NoJenis ternakKarakterEkspresi dominanEkspresi resesif

1SapiWarna kulitHitamMerah

2SapiWarna kulitHitamPutih

3SapiPola warnaUniformBelang, tutul

4SapiPola warnaFriesianPola Ayrshire atau Guernsey

5SapiPola mukaHereford muka putihMuka datar, sederhana

6SapiWarna tandukHitam ujungUjung jelas, bersih

7SapiKondisi tandukPolledBertanduk

8DombaWarna buluPutihHitam

9BabiBentuk mukaPanjang, dangkalDatar (lebar)

10BabiWarna kulitPutihRed